RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 DNAJB14Q8TBM8 379 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 TAS1R2Q8TE23 839 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 HMGB4Q8WW32 186 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 DNASE1L2Q92874 299 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 MIB2Q96AX9 1013 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 OMA1Q96E52 524 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 EEF2KMTQ96G04 330 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 B3GALT6Q96L58 329 aa4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 CHP1Q99653 195 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRIM15Q9C019 465 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 DERL2Q9GZP9 239 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAGT1Q9H0U3 335 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 DNTTIP1Q9H147 329 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 S1PR5Q9H228 398 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 MTG2Q9H4K7 406 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 DIABLOQ9NR28 239 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ELOVL2Q9NXB9 296 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ONECUT1Q9UBC0 465 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ERGIC3Q9Y282 383 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 WDR81Q562E7 1941 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRAV25A0A0B4J276 109 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 A0A0J9YVX5 310 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 A0A1W2PQF6 199 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC35F4A4IF30 521 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 FADS2P1A8MWK0 482 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 J3KTA2 159 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 K7ERI5 159 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 RAB27BO00194 218 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 GRM6O15303 877 aa4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ADRA2CP18825 462 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 UGT1A6P19224 532 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ACHEP22303 614 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 MST1P26927 711 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 RBL1P28749 1068 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 PREPP48147 710 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC6A3Q01959 620 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SNTA1Q13424 505 aa4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 LIPNQ5VXI9 398 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 WSCD1Q658N2 575 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 TAC4Q86UU9 113 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SFR1Q86XK3 245 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 STKLD1Q8NE28 680 aa4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 KLHL29Q96CT2 875 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 HAVCR1Q96D42 359 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 RNFT2Q96EX2 444 aa4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 TINAGQ9UJW2 476 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SNX7Q9UNH6 387 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.85□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.85□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 CENPBD1B2RD01 187 aa4.84□□□□□ -1.63
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 WNT9AO14904 365 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 PJA2O43164 708 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 GAS2O43903 313 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 VPS26AO75436 327 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 GLP2RO95838 553 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 BCL10O95999 233 aa4.84□□□□□ -1.63
TRAPPC11-208ENST00000511955 CXCL10P02778 98 aa4.84□□□□□ -1.63
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