RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509018.5

RAPGEF6-208, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 8,357 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-208ENST00000509018 PDYNP01213 254 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PTAFRP25105 342 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRKCIP41743 596 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ARF1P84077 181 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCNJQ5T5M9 372 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PARM1Q6UWI2 310 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 DPH7Q9BTV6 452 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 MRIQ9BWK5 157 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 RHOJQ9H4E5 214 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 LRRC19Q9H756 370 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 AGLP35573 1532 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRBC2A0A5B9 178 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PTGESO14684 152 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CPOXP36551 454 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CDKN2DP55273 166 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CDKL1Q00532 357 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PRKCDQ05655 676 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZP2Q05996 745 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 BMT2Q1RMZ1 405 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF100Q8IYN0 542 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 RNF38Q9H0F5 515 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.13□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 DAPL1A0PJW8 107 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SHISA7A6NL88 538 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 H0Y8X5 98 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 GSC2O15499 205 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 NADKO95544 446 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CD79AP11912 226 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 NR4A2P43354 598 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 JAM2P57087 298 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 DSTNP60981 165 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 LYSMD4Q5XG99 296 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ARL9Q6T311 187 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC36A4Q6YBV0 504 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 KCTD9Q7L273 389 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 VASH2Q86V25 355 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 IFNW1P05000 195 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCR8P51685 355 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ADHFE1Q8IWW8 467 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PIGXQ8TBF5 258 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 OR2M4Q96R27 311 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 IFT46Q9NQC8 304 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 C1orf109Q9NX04 203 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SERTAD3Q9UJW9 196 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 M0R2N6 131 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ARSDP51689 593 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 PMS2P3Q13401 168 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 DMRTC1Q5HYR2 192 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF852Q6ZMS4 543 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TRABD2AQ86V40 505 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ZNF101Q8IZC7 436 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCDC107Q8WV48 283 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 STRADBQ9C0K7 418 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 NARFLQ9H6Q4 476 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 KCND3Q9UK17 655 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 F11P03951 625 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 HCKP08631 526 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 BLKP51451 505 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 LIMK2P53671 638 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SYVN1Q86TM6 617 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 KLHL31Q9H511 634 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 C5orf60A6NFR6 353 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 KHKP50053 298 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 KCNAB1Q14722 419 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TTC23Q5W5X9 447 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 TMEM225Q6GV28 225 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 SLC44A1Q8WWI5 657 aa7.12□□□□□ -1.27
RAPGEF6-208ENST00000509018 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.4 ms