RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437607.1

PTPRF-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-208ENST00000437607 PKLRP30613 574 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 HSD17B2P37059 387 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 AGTR2P50052 363 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 TBPL1P62380 186 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 CHAF1BQ13112 559 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 PRKG2Q13237 762 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 TUBB3Q13509 450 aa11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTPRF-208ENST00000437607 IL10RAQ13651 578 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 C4orf17Q53FE4 359 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 SNX31Q8N9S9 440 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 MAP3K3Q99759 626 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 THAP1Q9NVV9 213 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTPRF-208ENST00000437607 K7EPI3 171 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 MLYCDO95822 493 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 TEX9Q8N6V9 391 aa11.64□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 SLC38A9Q8NBW4 561 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 C7orf26Q96N11 449 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 DNAJC11Q9NVH1 559 aa11.64□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 E2F3O00716 465 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 TAPBPO15533 448 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 SNNO75324 88 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 GGT5P36269 586 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 LCN9Q8WX39 176 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 SMPDL3AQ92484 453 aa11.63□□□□□ -0.55
PTPRF-208ENST00000437607 ATP6V1E2Q96A05 226 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTPRF-208ENST00000437607 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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