RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 CHIT1Q13231 466 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 UBE2E3Q969T4 207 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 COL26A1Q96A83 441 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SPNS1Q9H2V7 528 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 NT5DC2Q9H857 520 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF304Q9HCX3 659 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 COPEO14579 308 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CREG1O75629 220 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ONECUT2O95948 504 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 STATHP02808 62 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ATXN8OSP0DMR3 200 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 WT1P19544 449 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CASP2P42575 452 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 PCDH1Q08174 1060 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 DOC2AQ14183 400 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SH2D5Q6ZV89 423 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SYVN1Q86TM6 617 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM151AQ8N4L1 468 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 FKBP10Q96AY3 582 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SEC16AO15027 2179 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 URADA6NGE7 173 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 FOXO6A8MYZ6 492 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ALBP02768 609 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CAPN1P07384 714 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 EPORP19235 508 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CRHR1P34998 444 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 AVPR1BP47901 424 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 GTF2H2Q13888 395 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SLC9A5Q14940 896 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 C16orf46Q6P387 395 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 MACROD1Q9BQ69 325 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 COPG2Q9UBF2 871 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 TCFL5Q9UL49 500 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 MAU2Q9Y6X3 613 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ZFHX4Q86UP3 3567 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ANKDD1BA6NHY2 528 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 WFS1O76024 890 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 HPDP32754 393 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 OR1D4P47884 311 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 KRT71Q3SY84 523 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC153Q494R4 210 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 OVCH1Q7RTY7 1134 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CROCCP2Q86T23 111 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SLC22A9Q8IVM8 553 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD53Q8N9V6 530 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 KCT2Q8NC54 265 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 NT5CQ8TCD5 201 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CRELD1Q96HD1 420 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 IPPKQ9H8X2 491 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ACTR8Q9H981 624 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SLC22A7Q9Y694 548 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CACNA1BQ00975 2339 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 A8MT66 165 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 E2F3O00716 465 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SERPINA6P08185 405 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SBK3P0C264 359 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ITGAXP20702 1163 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 FBLP22087 321 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SKP1P63208 163 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 NFKB2Q00653 900 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 HERC3Q15034 1050 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ATP6V1E2Q96A05 226 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 RUFY1Q96T51 708 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ANKHQ9HCJ1 492 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 PRM3Q9NNZ6 103 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 LRRC14BA6NHZ5 514 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 H0YIG0 161 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 NKX2-8O15522 239 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 UGDHO60701 494 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF4O60810 478 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 MED26O95402 600 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 HNF4AP41235 474 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 CYP4F2P78329 520 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 SLC18A2Q05940 514 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 DSG2Q14126 1118 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 E2F2Q14209 437 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ERV3-1Q14264 604 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 LIPJQ5W064 366 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 NIPAL1Q6NVV3 410 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 ABHD13Q7L211 337 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-204ENST00000400919 TRABD2AQ86V40 505 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms