RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 E7EQ34 232 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TAF4O00268 1085 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 NUAK1O60285 661 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HIST1H2ADP20671 130 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 STK19P49842 368 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 LIMK1P53667 647 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.491e-8■□□□□ 8.5
CITED2-201ENST00000367651 USP43Q70EL4 1123 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SPATC1Q76KD6 591 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 AKAP14Q86UN6 197 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 NLGN4XQ8N0W4 816 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SPPL2AQ8TCT8 520 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CTRCQ99895 268 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 H2AFJQ9BTM1 129 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TNFRSF11BO00300 401 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SNPHO15079 494 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 C8GP07360 202 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HLA-EP13747 358 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 GABRB1P18505 474 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 RGNQ15493 299 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HKDC1Q2TB90 917 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 COX20Q5RI15 118 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HEATR4Q86WZ0 1026 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 METTL4Q8N3J2 472 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PSD4Q8NDX1 1056 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ZIC5Q96T25 663 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SLX1AQ9BQ83 275 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 GPATCH2Q9NW75 528 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PADI2Q9Y2J8 665 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa18.12■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SOCS5O75159 536 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 IRF8Q02556 426 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 RETSATQ6NUM9 610 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 OR10G2Q8NGC3 310 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 DOHHQ9BU89 302 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SPASTQ9UBP0 616 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SERTM1A2A2V5 107 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 GFYI3L273 518 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PSMD11O00231 422 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 DPM1O60762 260 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ALOX12P18054 663 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CD70P32970 193 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 BMPR1AP36894 532 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HNMTP50135 292 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 IFITM2Q01629 132 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TP53BP2Q13625 1128 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 XKR6Q5GH73 641 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PNCKQ6P2M8 343 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TTC23LQ6PF05 361 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CLIP4Q8N3C7 705 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 OR9Q2Q8NGE9 314 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 OR4C15Q8NGM1 316 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ELMO1Q92556 727 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 MYDGFQ969H8 173 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ASIC4Q96FT7 647 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 HOXD1Q9GZZ0 328 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 YIPF1Q9Y548 306 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ALPK3Q96L96 1907 aa18.11■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TTC36A6NLP5 189 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 J3KTA2 159 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 PRMT3O60678 531 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 C1SP09871 688 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 LMAN2Q12907 356 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 ARMCX4Q5H9R4 360 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 MLIPQ5VWP3 458 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 TUBA3EQ6PEY2 450 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 UTS2BQ765I0 119 aa18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CITED2-201ENST00000367651 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms