RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348161.8

TOM1L1-201, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TOM1L1, Length 1,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L1-201ENST00000348161 ENAMQ9NRM1 1142 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1L1-201ENST00000348161 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1L1-201ENST00000348161 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TOM1L1-201ENST00000348161 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1L1-201ENST00000348161 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.65□□□□□ -0.06
TOM1L1-201ENST00000348161 KIF26BQ2KJY2 2108 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DLGAP3O95886 979 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 HKDC1Q2TB90 917 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DPH1Q9BZG8 443 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 LHX9Q9NQ69 397 aa14.64□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 A0A1B0GX78 115 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PRAMEF4O60810 478 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PCNAP12004 261 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CYP4F2P78329 520 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 E2F2Q14209 437 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 UNC50Q53HI1 259 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DTX1Q86Y01 620 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 MR1Q95460 341 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 NKD1Q969G9 470 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CDC14AQ9UNH5 594 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PCM1Q15154 2024 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 OR7A17O14581 309 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 STATHP02808 62 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 NEFHP12036 1026 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TSPAN8P19075 237 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CD22P20273 847 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SERPINB1P30740 379 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PHEXP78562 749 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 LCP2Q13094 533 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 FAM53BQ14153 422 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PCLAFQ15004 111 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 C1orf189Q5VU69 101 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PRMT9Q6P2P2 845 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PROSER1Q86XN7 944 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DSELQ8IZU8 1212 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 MVB12AQ96EY5 273 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DCBLD2Q96PD2 775 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CDK15Q96Q40 435 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 RNF11Q9Y3C5 154 aa14.63□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 DSCR3O14972 297 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 KLK10O43240 276 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CLEC3AO75596 197 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 CAPNS1P04632 268 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SERPINA6P08185 405 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TCN2P20062 427 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ALDH3A1P30838 453 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SKP1P63208 163 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 GPS2Q13227 327 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TGIF1Q15583 401 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ABHD13Q7L211 337 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 NUDCD3Q8IVD9 361 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 LAS2Q8IYD9 372 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 KCT2Q8NC54 265 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 OR7G3Q8NG95 312 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TLCD1Q96CP7 247 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 EFHD1Q9BUP0 239 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 RHBGQ9H310 441 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 SYNPO2LQ9H987 977 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 ACSS2Q9NR19 701 aa14.62□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 TMEM120BA0PK00 339 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 C9J4A7 227 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1L1-201ENST00000348161 H0YIV9 168 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms