RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289672.6

PKD1L1-201, Transcript of polycystin 1 like 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKD1L1, Length 9,092 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L1-201ENST00000289672 SHPRHQ149N8 1683 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 TGM6O95932 706 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LPLP06858 475 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 GPR139Q6DWJ6 353 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PXKQ7Z7A4 578 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ANKRD46Q86W74 232 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PRKAB1Q9Y478 270 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 INSIG1O15503 277 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC7A4O43246 635 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LILRB5O75023 590 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PSPHP78330 225 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ITPK1Q13572 414 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PLA2G15Q8NCC3 412 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PROKR1Q8TCW9 393 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PHOX2BQ99453 314 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 VPS29Q9UBQ0 182 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SEPT4O43236 478 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PROM1O43490 865 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SCNN1GP51170 649 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CDH11P55287 796 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 NPNTQ6UXI9 565 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 BEST3Q8N1M1 668 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LRRC58Q96CX6 371 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LDAHQ9H6V9 325 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 D6RAR5 112 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 RAC2P15153 192 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 HOXA9P31269 272 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CDK3Q00526 305 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 OR52B2Q96RD2 323 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 C1orf21Q9H246 121 aa8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ACTL6BO94805 426 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PTPRAP18433 802 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 NUMBP49757 651 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 KCTD9Q7L273 389 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 RNF128Q8TEB7 428 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FKBP10Q96AY3 582 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 GPR21Q99679 349 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FSCN2O14926 492 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ABCB7O75027 752 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CYP3A5P20815 502 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 MAGEA8P43361 318 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ABCG1P45844 678 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ART1P52961 327 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PTPRRQ15256 657 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ELMOD2Q8IZ81 293 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 TM9SF4Q92544 642 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SYT3Q9BQG1 590 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PCTPQ9UKL6 214 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 RNF6Q9Y252 685 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SCN11AQ9UI33 1791 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 RBBP9O75884 186 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 LGALS2P05162 132 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 BMP6P22004 513 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 THBS2P35442 1172 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 RAB5CP51148 216 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 C9orf57Q5W0N0 161 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SLC22A16Q86VW1 577 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 OR4K3Q96R72 315 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 TWNKQ96RR1 684 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 A8MVJ9 347 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 PIP5K1CO60331 668 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 DFNA5O60443 496 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 B4GALT4O60513 344 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 SFTPBP07988 381 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 UQCRC1P31930 480 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 DSTNP60981 165 aa8.49□□□□□ -1.05
PKD1L1-201ENST00000289672 KCNC4Q03721 635 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms