RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 STT3BQ8TCJ2 826 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 TM4SF19Q96DZ7 209 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 THAP11Q96EK4 314 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ABHD17AQ96GS6 310 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 GPR78Q96P69 363 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ING2Q9H160 280 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 NUDT4Q9NZJ9 180 aa23.01■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ESPNB1AK53 854 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 K7EM74 188 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 PRAMEF4O60810 478 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ALOX12BO75342 701 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 KRT38O76015 456 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 KLHL2O95198 593 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SSPNQ14714 243 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 NDUFA9Q16795 377 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 LAPTM4BQ86VI4 370 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 MIEF2Q96C03 454 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 AIF1LQ9BQI0 150 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 FAM117AQ9C073 453 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 HCN3Q9P1Z3 774 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CDC14AQ9UNH5 594 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 COL6A6A6NMZ7 2263 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CFAP46Q8IYW2 2715 aa23■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 LRRC14BA6NHZ5 514 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 A6NL46 340 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SGK494L7N484 410 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 RFPL1O75677 317 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ALBP02768 609 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 GNAZP19086 355 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 GGT5P36269 586 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SLC26A3P40879 764 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SCTRP47872 440 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 OCA2Q04671 838 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 KLC1Q07866 573 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 RAPSNQ13702 412 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 COLEC12Q5KU26 742 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SLC26A1Q9H2B4 701 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 WDR54Q9H977 334 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ACSS2Q9NR19 701 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 MTHFD2P13995 350 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 MAGEA12P43365 314 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 DSG2Q14126 1118 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 PDK4Q16654 411 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 FAAH2Q6GMR7 532 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 KLC3Q6P597 504 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 PDSS2Q86YH6 399 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SCYL1Q96KG9 808 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CRB3Q9BUF7 120 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CD244Q9BZW8 370 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ZFP69BQ9UJL9 534 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.99■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CLGNO14967 610 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 RDH16O75452 317 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 JRKO75564 520 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CD63P08962 238 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 GFAPP14136 432 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 EPORP19235 508 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 AVPR1BP47901 424 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 FAM53BQ14153 422 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ACAP2Q15057 778 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 PFKFB4Q16877 469 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 XKR6Q5GH73 641 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.277e-6■■■■■ 46.4
PPP4C-201ENST00000279387 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ISL2Q96A47 359 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 MVB12AQ96EY5 273 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ADNPQ9H2P0 1102 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 KLHL31Q9H511 634 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 P4HTMQ9NXG6 502 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.98■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 MAP2K7O14733 419 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SHBGP04278 402 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 ATG9BQ674R7 924 aa22.97■■□□□ 1.27
PPP4C-201ENST00000279387 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms