RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 GDF5P43026 501 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 GDI2P50395 445 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 DCDC1P59894 354 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ERVK-8P63133 956 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 CAMK1Q14012 370 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 DECR1Q16698 335 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 REP15Q6BDI9 236 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SMARCD3Q6STE5 483 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TDRPQ86YL5 185 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SPAG16Q8N0X2 631 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 OXR1Q8N573 874 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 FRMD6Q96NE9 622 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 RETREG1Q9H6L5 497 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 AGR2O95994 175 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 FHP07954 510 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PTPRCAPQ14761 206 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 C12orf40Q86WS4 652 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 HHIPL1Q96JK4 782 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 FBRSQ9HAH7 460 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ZNF358Q9NW07 568 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TESMINQ9Y4I5 508 aa13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 FAM170BA6NMN3 283 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 I3L521 148 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PCDHGA12O60330 932 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 JUNP05412 331 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 DRD1P21728 446 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ARMC5Q96C12 935 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 COL21A1Q96P44 957 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 OR51B5Q9H339 312 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 NOX1Q9Y5S8 564 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ACADLP28330 430 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 CCR10P46092 362 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.271e-8■■■■■ 49.2
USP22-201ENST00000261497 KLHDC10Q6PID8 442 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 RNF121Q9H920 327 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 FZD3Q9NPG1 666 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 MED31Q9Y3C7 131 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TBX10O75333 385 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 AHSGP02765 367 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 CXCL12P48061 93 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 BNIP3Q12983 259 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 OLIG2Q13516 323 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 GFOD2Q3B7J2 385 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP13.38□□□□□ -0.272e-8■■□□□ 11.8
USP22-201ENST00000261497 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 CHIAQ9BZP6 476 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 GNALP38405 381 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 CBX5P45973 191 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PXNP49023 591 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 HERC3Q15034 1050 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ZNF615Q8N8J6 731 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 IFT27Q9BW83 186 aa13.38□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 EFCAB9A8MZ26 197 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 H7BY64 318 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PDLIM1O00151 329 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ITGB1P05556 798 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 F7P08709 466 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 THEGLP0DJG4 465 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PSKH1P11801 424 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 CDH1P12830 882 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ITIH1P19827 911 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 DNASE1L1P49184 302 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 IQCHQ86VS3 1027 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 TRAM1L1Q8N609 369 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PRAP1Q96NZ9 151 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SLC2A13Q96QE2 648 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PTGES2Q9H7Z7 377 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 MALT1Q9UDY8 824 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 GRXCR1A8MXD5 290 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SDC3O75056 442 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SP140Q13342 867 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 EGFL6Q8IUX8 553 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 HSPBAP1Q96EW2 488 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PEBP4Q96S96 227 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 ANKRA2Q9H9E1 313 aa13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
USP22-201ENST00000261497 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms