RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038514.14

Nup54-201, Transcript of Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nup54, Length 2,352 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr169Q7TS53 313 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Aoc2Q812C9 757 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Guf1Q8C3X4 651 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Prmt5Q8CIG8 637 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cdc16Q8R349 620 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 NrmQ8VC65 262 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Vps4aQ8VEJ9 437 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mthfd1Q922D8 935 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Tex13bQ99MW5 186 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 A0A286YDU1 74 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm19965J3QNY8 723 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm8897L7N294 181 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 FiglaO55208 194 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dhcr7O88455 471 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 P01878 344 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hoxd4P10628 250 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 QrfprP83861 433 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nxf3Q4ZGD9 553 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 AbrQ5SSL4 859 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Snta1Q61234 503 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Foxj1Q61660 421 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ugt2a2Q6PDD0 528 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ube2r2Q6ZWZ2 238 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fblim1Q71FD7 375 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr735Q7TRM4 354 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cpsf4Q8BQZ5 211 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Abi1Q8CBW3 481 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zc2hc1cQ8CCG1 527 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Map2k7Q8CE90 535 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ift80Q8K057 777 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Vmn1r30Q8R2D2 302 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Akr1c20Q8VC77 323 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ccdc92Q8VDN4 314 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Asb17Q8VHP9 295 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Acsm1Q91VA0 573 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hyal6Q9D4E9 494 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Galk1Q9R0N0 392 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dctn3Q9Z0Y1 186 aa14.51□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Col24a1Q30D77 1733 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm7682A0A0J9YUM1 481 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm3488M0QW81 238 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc22a8O88909 537 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ctla2aP12399 137 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rab12P35283 243 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 GcgP55095 180 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 InhaQ04997 366 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Runx1t1Q61909 577 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pou4f2Q63934 411 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 OmpQ64288 163 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Il20raQ6PHB0 546 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr1355Q7TQU9 310 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rhox11Q810N8 206 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gpat3Q8C0N2 438 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kctd2Q8CEZ0 266 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Thap1Q8CHW1 210 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Adgrg1Q8K209 687 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ahi1Q8K3E5 1047 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Klk6Q91Y82 253 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 GhdcQ99J23 532 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Abtb1Q99LJ2 478 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ndufb5Q9CQH3 189 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Acbd7Q9D258 88 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cst9Q9Z0H6 137 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 RgrQ9Z2B3 291 aa14.5□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm13088A2AGW6 460 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 AU018091E9PWS4 684 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm6811E9Q3Y8 510 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Arhgap40E9Q6X9 672 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm17615E9Q9P2 165 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm17019K7N6W5 255 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 NsmafO35242 920 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pold1P52431 1105 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ankrd28Q505D1 1053 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cdh12Q5RJH3 794 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Bcl2l1Q64373 233 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Egfl8Q6GUQ1 293 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 DgkbQ6NS52 802 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Plekha8Q80W71 519 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Crlf2Q8CII9 359 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Plac9Q8K262 108 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Znf668Q8K2R5 619 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 CcsapQ8QZT2 252 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr850Q8VFF2 315 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mcoln1Q99J21 580 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Dppa5aQ9CQS7 118 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kbtbd12Q9D618 625 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mrpl46Q9EQI8 283 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zfp952B0V2W4 504 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fam46dB1ATX6 390 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm8922F6XVS9 199 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Itm2bO89051 266 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kcnn4O89109 425 aa14.49□□□□□ -0.09
Nup54-201ENSMUST00000038514 IghmP01872 454 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.8 ms