RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Neto1Q8R4I7 533 aa9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gipc3Q8R5M0 297 aa9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr668Q8VGW3 318 aa9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EtfaQ99LC5 333 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cstf3Q99LI7 717 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lpar2Q9JL06 348 aa9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Socs6Q9JLY0 533 aa9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pias4Q9JM05 507 aa9.64□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r125D3Z3M1 369 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2b23E9Q593 491 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ackr2O08707 378 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp2O88623 613 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FurinP23188 793 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2f2P33267 491 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kcnj9P48543 393 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rps3P62908 243 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fcho2Q3UQN2 809 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10392Q3V3I3 114 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MslnQ61468 625 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr169Q7TS53 313 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nipal3Q8BGN5 410 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gjd4Q8BSD4 364 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cfap20Q8BTU1 193 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Casp9Q8C3Q9 454 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Teddm1bQ8CC62 306 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krtcap3Q8K177 240 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg10Q8R1P4 215 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uhrf1Q8VDF2 782 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Uts2rQ8VIH9 385 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hemk1Q921L7 340 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Themis3Q9CU24 569 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znrf4Q9DAH2 327 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il21rQ9JHX3 529 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Elovl2Q9JLJ4 292 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plag1Q9QYE0 499 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ramp2Q9WUP0 189 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm13089A2AGW7 455 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm11127A7VMS2 374 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Apol11bE9PUZ0 337 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Msl3l2G3X992 371 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3159K7N760 267 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pbx3O35317 434 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PhyhO35386 338 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc22a2O70577 553 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stk16O88697 305 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Stat6P52633 837 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mkl2P59759 1080 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4933415F23RikQ14BX6 153 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Alg10bQ3UGP8 474 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr8Q60892 310 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Med22Q62276 200 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sqstm1Q64337 442 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubash3bQ8BGG7 638 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mpp7Q8BVD5 576 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abi3Q8BYZ1 367 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnot2Q8C5L3 540 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PiguQ8K358 434 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd276Q8VE98 316 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chchd4Q8VEA4 139 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr30Q8VGD8 315 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Taldo1Q93092 337 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cryl1Q99KP3 319 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem179bQ9CY24 219 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc69Q9D9Q0 347 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olig2Q9EQW6 323 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Panx1Q9JIP4 426 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scube2Q9JJS0 997 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mid2Q9QUS6 705 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbp1Q9QY24 411 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Baz2bA2AUY4 2123 aa9.63□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prrg1A2BFE8 218 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 5830411N06RikB3F5L4 1112 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prss56F2YMG0 604 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LipiF6YQT7 476 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fmo6J3QMN6 532 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm17174M0QWQ9 212 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp8b1O88962 500 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nr4a1P12813 601 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cers1P27545 350 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc1a5P51912 553 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hmgcs2P54869 508 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MylpfP97457 169 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spata6Q3U6K5 488 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgef15Q5FWH6 849 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem199Q5SYH2 208 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sdf4Q61112 361 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cd300lfQ6SJQ7 337 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1415Q7TQS4 311 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NraddQ8CJ26 228 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1416Q8VGU4 312 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc3a1Q91WV7 685 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Them5Q9CQJ0 248 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prelid3bQ9CYY7 195 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dgat1Q9Z2A7 498 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem131O70472 1877 aa9.62□□□□□ -0.87
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7697A0A0J9YUH2 350 aa9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.9 ms