RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ABATP80404 500 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PTK6Q13882 451 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 H3F3CQ6NXT2 135 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A8Q8N695 610 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51Q1Q8NH59 317 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BMM5 538 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MAN1A2O60476 641 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ETS1P14921 441 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF24P17028 368 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 IL1RNP18510 177 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R50P59544 299 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL38Q2WGJ6 581 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSBG2Q5FVE4 666 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A25Q6KCM7 469 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MRNIPQ6NTE8 343 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 DOLPP1Q86YN1 238 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC89Q8N998 374 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 M1APQ8TC57 530 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 BIRC8Q96P09 236 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ENKD1Q9H0I2 346 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NF1P21359 2839 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 E5RI56 91 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 E9PLN8 166 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PFDN6O15212 129 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LIASO43766 372 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NSA2O95478 260 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SP1P08047 785 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CD1EP15812 388 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NMBRP28336 390 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MEI1Q5TIA1 1274 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SIAH3Q8IW03 269 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SHISA5Q8N114 240 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NPAS2Q99743 824 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 VKORC1Q9BQB6 163 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM51Q9BSJ1 452 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPY26PQ9H489 355 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TREX1Q9NSU2 369 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LRFN1Q9P244 771 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MED13LQ71F56 2210 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA8TH3BQL2 631 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 H7BY64 318 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SGK494L7N484 410 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 VAPBO95292 243 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A8O95907 504 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GBX1Q14549 363 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SFT2D3Q587I9 215 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1328Q86T90 577 aa25.78■■□□□ 1.72
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CAPNS1-217ENST00000629983 ACRBPQ8NEB7 543 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF480Q8WV37 535 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LPGAT1Q92604 370 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PRAP1Q96NZ9 151 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 LPAR4Q99677 370 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 RBCK1Q9BYM8 510 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM5Q9C035 493 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP25Q9NPA2 562 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYL1Q9Y2S2 319 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 NADKO95544 446 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ESR1P03372 595 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 RELAQ04206 551 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX1Q13596 522 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ11Q14654 390 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 OASLQ15646 514 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MACROD1Q9BQ69 325 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKHQ9HCJ1 492 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 BFARQ9NZS9 450 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PAK5Q9P286 719 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GALPQ9UBC7 116 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
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CAPNS1-217ENST00000629983 E7ENX8 843 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NDC80O14777 642 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A12O75746 678 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 TAP2Q03519 686 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NSDHLQ15738 373 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CES3Q6UWW8 571 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf54Q8WWF1 131 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 DMRTA2Q96SC8 542 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 IL22Q9GZX6 179 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCP1Q9H5V8 836 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 RDH16O75452 317 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 NEURL1O76050 574 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL6P41182 706 aa25.75■■□□□ 1.71
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