RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 U3KQ87 197 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 COL1A2P08123 1366 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FABP12A6NFH5 140 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 POM121CA8CG34 1229 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PIRO00625 290 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 AOC2O75106 756 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PNPLA4P41247 253 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KCNQ1P51787 676 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 BNC1Q01954 994 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ST3GAL4Q11206 333 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LRRC32Q14392 662 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZBTB6Q15916 424 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 UGT8Q16880 541 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM171A1Q5VUB5 890 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A9Q8IVM8 553 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CHPFQ8IZ52 775 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RDH10Q8IZV5 341 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR7D4Q8NG98 312 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TEKT5Q96M29 485 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 IFT22Q9H7X7 185 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GALPQ9UBC7 116 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DERAQ9Y315 318 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LINC00862A6NCI5 91 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GFRA2O00451 464 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PCDH17O14917 1159 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NCAM2O15394 837 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KATNA1O75449 491 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CREG1O75629 220 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TOXO94900 526 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ALPPP05187 535 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ACADMP11310 421 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 HMGCLP35914 325 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CLCN4P51793 760 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ARHGDIBP52566 201 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 POU4F1Q01851 419 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MAB21L1Q13394 359 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KANK2Q63ZY3 851 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C17orf107Q6ZR85 190 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 IFNL1Q8IU54 200 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 UPRTQ96BW1 309 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KLHL15Q96M94 604 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 QRFPRQ96P65 431 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PPA2Q9H2U2 334 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FBXW11Q9UKB1 542 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NOD1Q9Y239 953 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ASB1Q9Y576 335 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KCTD3Q9Y597 815 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR5K4A6NMS3 321 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CXCL11O14625 94 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MYL12BO14950 172 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFA2O43678 99 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR4F21O95013 312 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PRSS56P0CW18 603 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ITGAMP11215 1152 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DARSP14868 501 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MYL12AP19105 171 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SCNN1AP37088 669 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CPT1AP50416 773 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DAOAP59103 153 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ELP6Q0PNE2 266 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FCN2Q15485 313 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM209BQ5JX69 171 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CST9Q5W186 159 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PAQR9Q6ZVX9 377 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 BBS7Q8IWZ6 715 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms