RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590506.1

NEDD4L-229, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 2,743 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-229	ENST00000590506	HTR6	P50406	440 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	ZNF81	P51508	661 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CDT1	Q9H211	546 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	C1orf109	Q9NX04	203 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SRRD	Q9UH36	339 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FKBP7	Q9Y680	259 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	LGALS8	O00214	317 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CBX4	O00257	560 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PSMD3	O43242	534 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	LYRM1	O43325	122 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PROM1	O43490	865 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	OR1I1	O60431	355 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	GMDS	O60547	372 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	TSPAN12	O95859	305 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PLAT	P00750	562 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	HRG	P04196	525 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	GJB1	P08034	283 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PRKAR1A	P10644	381 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	NPR1	P16066	1061 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	RAB3A	P20336	220 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	BMP8B	P34820	402 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	GGT2	P36268	569 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	MAGEA2	P43356	314 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SNX16	P57768	344 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	VLDLR	P98155	873 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	IKZF1	Q13422	519 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	DUSP6	Q16828	381 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	OR4F3	Q6IEY1	312 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	RTL4	Q6ZR62	310 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21	2e-6	■■■□□ 17.1
NEDD4L-229	ENST00000590506	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	RERGL	Q9H628	205 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PIGV	Q9NUD9	493 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	GALP	Q9UBC7	116 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506		A0A1W2PPL8	197 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PRAMEF10	O60809	474 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC43A1	O75387	559 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	AP2A2	O94973	939 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FAM157B	P0CG42	384 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CKMT1A	P12532	417 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CLCN3	P51790	818 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	PTGR1	Q14914	329 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	NR6A1	Q15406	480 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-229	ENST00000590506	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.47	□□□□□ -1.21

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