RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 LIPNQ5VXI9 398 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 Q7L0L9 218 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 UFD1Q92890 307 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 COPS8Q99627 209 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PIP5K1AQ99755 562 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL22Q9GZX6 179 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD17A6NE02 478 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 M0R233 179 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AIPO00170 330 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PHYHO14832 338 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TBX1O43435 398 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RAD51CO43502 376 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GALTP07902 379 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RAC1P63000 192 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FADDQ13158 208 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LLGL1Q15334 1064 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GPR68Q15743 365 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SETD9Q8NE22 299 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HMGB4Q8WW32 186 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 COPS3Q9UNS2 423 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LRP5O75197 1615 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0A0MRY4 1105 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SMCO3A2RU48 225 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ACOX3O15254 700 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SSX4O60224 188 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SMPD2O60906 423 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C1RP00736 705 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GRIA1P42261 906 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AVPR1BP47901 424 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CARFQ8N187 725 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 VN1R2Q8NFZ6 395 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LRFN1Q9P244 771 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LCHNA4D1U4 455 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GSC2O15499 205 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GJB5O95377 273 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31D3P0C874 917 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PGAM1P18669 254 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC5A2P31639 672 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PSME3P61289 254 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RAB33AQ14088 237 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WDR48Q8TAF3 677 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GATA6Q92908 595 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35C1Q96A29 364 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ISOC1Q96CN7 298 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 UCK1Q9HA47 277 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WHRNQ9P202 907 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087X1B8 175 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A096LPI6 279 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2QL1A1L167 161 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.13□□□□□ -1.43
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