RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 VAPBO95292 243 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 OR56A5P0C7T3 313 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 EPXP11678 715 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 OGNP20774 298 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TTPAP49638 278 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ARL4DP49703 201 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ITGA8P53708 1063 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PPP1CAP62136 330 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 HSD11B2P80365 405 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TAP2Q03519 686 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PMPCAQ10713 525 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 NFE2L1Q14494 772 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 SEMA3AQ14563 771 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 MLIPQ5VWP3 458 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 METRNLQ641Q3 311 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 DUPD1Q68J44 220 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CASC4Q6P4E1 433 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CES3Q6UWW8 571 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TREML4Q6UXN2 200 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ACAD11Q709F0 780 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PDIK1LQ8N165 341 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CARFQ8N187 725 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 D2HGDHQ8N465 521 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 BBOF1Q8ND07 529 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 GPR150Q8NGU9 434 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 LRRC39Q96DD0 335 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ERP44Q9BS26 406 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 GSX2Q9BZM3 304 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 COG4Q9H9E3 785 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 OR5K3A6NET4 321 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RNF223E7ERA6 249 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 E7ESA3 106 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 SYT5O00445 386 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PFDN6O15212 129 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 OR1I1O60431 355 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 KRT34O76011 436 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TTC4O95801 387 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 FTH1P02794 183 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 POLBP06746 335 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 UMODP07911 640 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 PGAM1P18669 254 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 32.6
CS-225ENST00000551253 ADARP55265 1226 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ARL4CP56559 192 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 HSF1Q00613 529 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RPA4Q13156 261 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 GPR19Q15760 415 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RPE65Q16518 533 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 MSS51Q4VC12 460 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 LRRC6Q86X45 466 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CILP2Q8IUL8 1156 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 LMNTD2Q8IXW0 634 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CLDN19Q8N6F1 224 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 KIF18AQ8NI77 898 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 FAM57AQ8TBR7 257 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CALML6Q8TD86 181 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 NAT14Q8WUY8 206 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ZFPM2Q8WW38 1151 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TCF12Q99081 682 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 NAT9Q9BTE0 207 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 CARD6Q9BX69 1037 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 RAB17Q9H0T7 212 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 WHRNQ9P202 907 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 GNPTGQ9UJJ9 305 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms