RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 NPC1O15118 1278 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TBX19O60806 448 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 UGT2B11O75310 529 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 JRKO75564 520 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SERPINA1P01009 418 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PRNPP04156 253 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SPATA31D3P0C874 917 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TIMP2P16035 220 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 DDX5P17844 614 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ITGB7P26010 798 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 IMPA1P29218 277 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SERPINB1P30740 379 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SHMT2P34897 504 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CCR2P41597 374 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PIK3CBP42338 1070 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CDH15P55291 814 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 DPTQ07507 201 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ACSM2AQ08AH3 577 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SIGLEC14Q08ET2 396 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 FCHO2Q0JRZ9 810 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ELP6Q0PNE2 266 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 HSPA14Q0VDF9 509 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 FADDQ13158 208 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 KCNAB2Q13303 367 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 LAPTM5Q13571 262 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PDE7AQ13946 482 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 GTDC1Q4AE62 458 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SYTL3Q4VX76 610 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ACSM2BQ68CK6 577 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 KDM4DQ6B0I6 523 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 AGTRAPQ6RW13 159 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 KCTD8Q6ZWB6 473 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TMEM25Q86YD3 366 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SYT12Q8IV01 421 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 VRK3Q8IV63 474 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 LAS2Q8IYD9 372 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 NATD1Q8N6N6 113 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ARL10Q8N8L6 244 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CHST14Q8NCH0 376 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 OR2T29Q8NH02 315 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 FBXO30Q8TB52 745 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 UBE2E3Q969T4 207 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 NCLNQ969V3 563 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 MUL1Q969V5 352 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 APIPQ96GX9 242 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 APOLD1Q96LR9 279 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 COQ10AQ96MF6 247 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 COG8Q96MW5 612 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 MUS81Q96NY9 551 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 EPYCQ99645 322 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 P2RY13Q9BPV8 354 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CORO1BQ9BR76 489 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CCM2Q9BSQ5 444 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SGPP1Q9BX95 441 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.85□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ARRDC5A6NEK1 342 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CLIC1O00299 241 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SLC1A7O00341 560 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 MBTPS2O43462 519 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 NOBOXO60393 691 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 LEFTY1O75610 366 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 SEMA3DO95025 777 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ADH1CP00326 375 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 RHOP08100 348 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 ERGP11308 486 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 CD22P20273 847 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TACR1P25103 407 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 TEAD1P28347 426 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 KDELR2P33947 212 aa8.84□□□□□ -0.99
RPS3-215ENST00000530170 HALP42357 657 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms