RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526151.5

PUF60-206, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 3

Gene PUF60, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-206	ENST00000526151	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151		H7BY64	318 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PCDHGA12	O60330	932 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF883	P0CG24	379 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PRPS2	P11908	318 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	BCKDHA	P12694	445 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PNLIP	P16233	465 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SDC1	P18827	310 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	BCL6	P41182	706 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	LSS	P48449	732 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	HYAL2	Q12891	473 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	BNIP3	Q12983	259 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PLCL1	Q15111	1095 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	MAPRE2	Q15555	327 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	OOSP2	Q86WS3	158 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	METTL4	Q8N3J2	472 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	OR4C6	Q8NH72	309 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	RSC1A1	Q92681	617 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SERPINI1	Q99574	410 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	RTKN	Q9BST9	563 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	AICDA	Q9GZX7	198 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151		U3KQA8	63 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151		A0A0J9YY10	115 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	OR6C74	A6NCV1	312 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	HAT1	O14929	419 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	NRP2	O60462	931 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PRMT3	O60678	531 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SDC3	O75056	442 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	KLHL18	O94889	574 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SCEL	O95171	688 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	THRA	P10827	490 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	G6PD	P11413	515 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	MAPK1	P28482	360 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PTPN4	P29074	926 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	IL12A	P29459	219 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	GPR3	P46089	330 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	STX1B	P61266	288 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PHEX	P78562	749 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	HLA-B	Q31612	363 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	IL23R	Q5VWK5	629 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	CEP68	Q76N32	757 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	PIGK	Q92643	395 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	TESC	Q96BS2	214 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	TEX37	Q96LM6	180 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	C1orf50	Q9BV19	199 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	FRYL	O94915	3013 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	FAM234B	A2RU67	622 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ASPDH	A6ND91	283 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ISM1	B1AKI9	464 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	FBP2	O00757	339 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	UBXN7	O94888	489 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PUF60-206	ENST00000526151	GLB1	P16278	677 aa		13.96	□□□□□ -0.17

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