RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	RAD1	O60671	282 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ODC1	P11926	461 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	HPGD	P15428	266 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PROZ	P22891	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PGM1	P36871	562 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PGF	P49763	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	METAP1	P53582	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PMS2	P54278	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ADPRH	P54922	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TAP2	Q03519	686 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	GPS2	Q13227	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB39A	Q14964	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MED22	Q15528	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636		Q4G0T1	1027 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	AAGAB	Q6PD74	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CD302	Q8IX05	232 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CORO2A	Q92828	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PANX2	Q96RD6	677 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP4R1L	Q9P1A2	415 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DERA	Q9Y315	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	DYSF	O75923	2080 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PABPC1-223	ENST00000523636	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A0G2JK05	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LIPT2	A6NK58	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636		E9PBE3	544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GMFG	O60234	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AKR7A3	O95154	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	AMY1A	P04745	511 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	IRF1	P10914	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ZNF18	P17022	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GNA11	P29992	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	LMAN1	P49257	510 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RARRES1	P49788	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	GNG11	P61952	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CBX1	P83916	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	NTRK2	Q16620	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PABPC1-223	ENST00000523636	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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