RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLVS1-205	ENST00000519846	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF480	Q8WV37	535 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	GATA6	Q92908	595 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NXNL1	Q96CM4	212 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C10orf142	B7Z368	130 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NKX2-8	O15522	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TIAF1	O95411	115 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PNLIP	P16233	465 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ACADL	P28330	430 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PKLR	P30613	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CLCN7	P51798	805 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	IRF9	Q00978	393 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ODF1	Q14990	250 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	EXTL1	Q92935	676 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PDE10A	Q9Y233	779 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	UBXN8	O00124	270 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MATN2	O00339	956 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SLCO2B1	O94956	709 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C2	P06681	752 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C8G	P07360	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TUBB	P07437	444 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CTSB	P07858	339 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	GSTM1	P09488	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	IL1RN	P18510	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RHCE	P18577	417 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MAGEA3	P43357	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RAB8A	P61006	207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RAB10	P61026	200 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RHD	Q02161	417 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	IRF8	Q02556	426 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	GSTM4	Q03013	218 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RBBP7	Q16576	425 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	GK5	Q6ZS86	529 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RBBP8	Q99708	897 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CROT	Q9UKG9	612 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A096LPE4	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846		A0A1W2PPZ6	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	RASGRF2	O14827	1237 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	NAT2	P11245	290 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	POU4F1	Q01851	419 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	LY6D	Q14210	128 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CLVS1-205	ENST00000519846	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms