RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 LIX1Q8N485 282 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 OR4F6Q8NGB9 312 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GPR151Q8TDV0 419 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TPD52L3Q96J77 140 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RERGLQ9H628 205 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 KCNN3Q9UGI6 736 aa13.06□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PQ09 198 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 LCHNA4D1U4 455 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 AKR7A2O43488 359 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FHP07954 510 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RING1Q06587 406 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CDONQ4KMG0 1287 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CTSL3PQ5NE16 218 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CHPFQ8IZ52 775 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CAMKK1Q8N5S9 505 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NARFLQ9H6Q4 476 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ACOXLQ9NUZ1 547 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SPASTQ9UBP0 616 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CFL2Q9Y281 166 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 OR6C75A6NL08 312 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 INSIG1O15503 277 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GUCA1CO95843 209 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TSPAN12O95859 305 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 EPOP01588 193 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 OGNP20774 298 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FPR1P21462 350 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PIK3CBP42338 1070 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ST3GAL4Q11206 333 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SMARCB1Q12824 385 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RUNDC3AQ59EK9 446 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 APH1BQ8WW43 257 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GGHQ92820 318 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 LINGO1Q96FE5 620 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PSKH2Q96QS6 385 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 C12orf4Q9NQ89 552 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ABCB8Q9NUT2 735 aa13.05□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 M0R129 80 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 E2F3O00716 465 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ERN1O75460 977 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 B3GALT4O96024 378 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FABP3P05413 133 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MYL9P24844 172 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MC4RP32245 332 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TSTQ16762 297 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZNF605Q86T29 641 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RNF180Q86T96 592 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PAF1Q8N7H5 531 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 FLCNQ8NFG4 579 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RIPOR3Q96MK2 946 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 GON7Q9BXV9 100 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RAD18Q9NS91 495 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TMEM161AQ9NX61 479 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ERVW-1Q9UQF0 538 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 B8ZZF3 427 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 COCHO43405 550 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ADORA3P0DMS8 318 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CR2P20023 1033 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 VLDLRP98155 873 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SCN1BQ07699 218 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PXDC1Q5TGL8 231 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ALG1LQ6GMV1 187 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 DOK6Q6PKX4 331 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 SNTG1Q9NSN8 517 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 HSPB11Q9Y547 144 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RAI2Q9Y5P3 530 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 CLCA1A8K7I4 914 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 H3BM21 787 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 STX16O14662 325 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 TNFRSF21O75509 655 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 UGT2B17O75795 530 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 COL6A1P12109 1028 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 PKLRP30613 574 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 IL2P60568 153 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 MXD1Q05195 221 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 BTBD16Q32M84 506 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
NISCH-212ENST00000488380 RNF170Q96K19 258 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms