RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALPK1Q96QP1 1244 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDC1Q9BTX1 674 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYTH4Q9UIA0 394 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A14Q9Y267 594 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOX14O95416 240 aa16.68■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BTN3A2P78410 334 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAP1Q01518 475 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.265e-13■□□□□ 8.4
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR33Q49SQ1 333 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCT2Q8NC54 265 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEPSINQ96N21 525 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUBA1CQ9BQE3 449 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDT15Q9NV35 164 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPEF2O14830 753 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NFATC1O95644 943 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM110Q86TL2 294 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TREML1Q86YW5 311 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 THAP6Q8TBB0 222 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TWNKQ96RR1 684 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF350Q9GZX5 532 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIGARQ9NQ88 270 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.68■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MASP1P48740 699 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARSFP54793 590 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF599Q96NL3 588 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSBPL2Q9H1P3 480 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMED5Q9Y3A6 229 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 J3KR12 359 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLGAP1O14490 977 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSF2P04141 144 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UGT8Q16880 541 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYVN1Q86TM6 617 aa16.67■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHOX2BQ99453 314 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCB8Q9NUT2 735 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC35F4A4IF30 521 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 M0R036 132 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SP2Q02086 613 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 27.4
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAB36O95755 333 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP4BP51164 291 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GALNT7Q86SF2 657 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.67■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TBX18O95935 607 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARF1P84077 181 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARFRP1Q13795 201 aa16.66■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PYHIN1Q6K0P9 492 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM17Q86X19 198 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C15orf40Q8WUR7 153 aa16.66■□□□□ 0.26
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DERL2Q9GZP9 239 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENAMQ9NRM1 1142 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCGB1D2O95969 90 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPPAP01160 153 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LCN1P31025 176 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCNN1AP37088 669 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAP2K4P45985 399 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABHD18Q0P651 414 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGMAQ96B86 450 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBXN7O94888 489 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF45Q02386 682 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP6AP1Q15904 470 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARD16Q5EG05 197 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC120Q96HB5 630 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMP27Q9H306 513 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.66■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KDM3BQ7LBC6 1761 aa16.66■□□□□ 0.26
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