RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	WDR54	Q9H977	334 aa		14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	GPR83	Q9NYM4	423 aa		14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	WWOX	Q9NZC7	414 aa		14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	OARD1	Q9Y530	152 aa		14.09	□□□□□ -0.15
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFS4	O43181	175 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SUV39H1	O43463	412 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	HEXB	P07686	556 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	IL1RN	P18510	177 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ITGA3	P26006	1051 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	BCL6	P41182	706 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	KLC1	Q07866	573 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	KLRB1	Q12918	225 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SYT16	Q17RD7	645 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	DCAF10	Q5QP82	559 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	GPSM1	Q86YR5	675 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	OR56A3	Q8NH54	315 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	VPS50	Q96JG6	964 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SPSB2	Q99619	263 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MFRP	Q9BY79	579 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	DERL2	Q9GZP9	239 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CD274	Q9NZQ7	290 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MAP10	Q9P2G4	905 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf18	Q9UK00	162 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	RNF112	Q9ULX5	631 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	14.08	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	AGPS	O00116	658 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MAP2K7	O14733	419 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ACSL3	O95573	720 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	PDGFA	P04085	211 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MMP11	P24347	488 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CXCR2	P25025	360 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	GMPR	P36959	345 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	HNF4A	P41235	474 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	GDF5	P43026	501 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	TLE1	Q04724	770 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CBLB	Q13191	982 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	BMPR2	Q13873	1038 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	DSG2	Q14126	1118 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT16	Q8N428	558 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CEP112	Q8N8E3	955 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SNX31	Q8N9S9	440 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	KCT2	Q8NC54	265 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CCT6B	Q92526	530 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	NEIL2	Q969S2	332 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf44	Q96CB5	159 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	THAP11	Q96EK4	314 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	MVB12A	Q96EY5	273 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	OR4K3	Q96R72	315 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	FMO2	Q99518	471 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT9	Q9BW91	350 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	LUZP4	Q9P127	313 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		14.07	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SGK494	L7N484	410 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	CLGN	O14967	610 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	FOXS1	O43638	330 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	SUPT3H	O75486	399 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ALPP	P05187	535 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ACPP	P15309	386 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	HNMT	P50135	292 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	EMP2	P54851	167 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	EMP3	P54852	163 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V0D1	P61421	351 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	RELA	Q04206	551 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	RGS1	Q08116	209 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	NAB1	Q13506	487 aa		14.06	□□□□□ -0.16
SSR4-208	ENST00000471880	TGFBI	Q15582	683 aa		14.06	□□□□□ -0.16

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