RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

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Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 PACSIN1Q9BY11 444 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 METTL7AQ9H8H3 244 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PANK3Q9H999 370 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 ITM2CQ9NQX7 267 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 C2orf42Q9NWW7 574 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 HMG20BQ9P0W2 317 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 CD300AQ9UGN4 299 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PILRAQ9UKJ1 303 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 RAB26Q9ULW5 256 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 USTQ9Y2C2 406 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa-0.73□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CDY2AQ9Y6F7 541 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 EFNB2P52799 333 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 NDST2P52849 883 aa-0.74□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 TBX4P57082 545 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TAS2R38P59533 333 aa-0.74□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 RPP30P78346 268 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 TRPC3Q13507 836 aa-0.74□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 MLC1Q15049 377 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 NECTIN1Q15223 517 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 PTPN14Q15678 1187 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 SLC10A6Q3KNW5 377 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 GPR139Q6DWJ6 353 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
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SNORD57-201ENST00000448188 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 GFRALQ6UXV0 394 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 Q6ZR03 302 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC149Q6ZUS6 474 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 SCXQ7RTU7 201 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 TTC7BQ86TV6 843 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 NT5DC3Q86UY8 548 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 MICU3Q86XE3 530 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 CALHM1Q8IU99 346 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 HACE1Q8IYU2 909 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 RBFAQ8N0V3 343 aa-0.74□□□□□ -2.53
SNORD57-201ENST00000448188 MINDY1Q8N5J2 469 aa-0.74□□□□□ -2.53
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