RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403084.1

CLDN5-201, Transcript of claudin 5, humanhuman

BASIC

Gene CLDN5, Length 2,357 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN5-201ENST00000403084 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SCD5Q86SK9 330 aa21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 FBXL6Q8N531 539 aa21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 GDPD1Q8N9F7 314 aa21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 HHATLQ9HCP6 504 aa21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 POFUT2Q9Y2G5 429 aa21.13■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SCG5P05408 212 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 GPX2P18283 190 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 GPR19Q15760 415 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SGO1Q5FBB7 561 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SAXO2Q658L1 398 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 FAM131AQ6UXB0 335 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PAMR1Q6UXH9 720 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 OMA1Q96E52 524 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SERPINB11Q96P15 392 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 HHIPQ96QV1 700 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 H3BM21 787 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ALDH9A1P49189 494 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 RUNX1T1Q06455 604 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SERINC3Q13530 473 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF235Q14590 738 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 FAM205BPQ63HN1 556 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 GPR155Q7Z3F1 870 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SLC5A8Q8N695 610 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MDGA1Q8NFP4 955 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 DUSP12Q9UNI6 340 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PADI2Q9Y2J8 665 aa21.12■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 RRN3P2A6NIE6 340 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 CLIC1O00299 241 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PLA2G10O15496 165 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TMCC2O75069 709 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 CSF2P04141 144 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PSKH1P11801 424 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PRPS2P11908 318 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 CTRB1P17538 263 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 CTRB2Q6GPI1 263 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 NELL1Q92832 810 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PDE9AO76083 593 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ARHGEF15O94989 841 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 COL6A1P12109 1028 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 IFI30P13284 250 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 NAGAP17050 411 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ENGP17813 658 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 DMC1Q14565 340 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 VEPH1Q14D04 833 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MS4A13Q5J8X5 152 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ALG1LQ6GMV1 187 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ENKURQ8TC29 256 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TPD52L3Q96J77 140 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 NTMT1Q9BV86 223 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SNTG1Q9NSN8 517 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TMLHEQ9NVH6 421 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 DHRS7Q9Y394 339 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PTPRDP23468 1912 aa21.11■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SH3D21A4FU49 640 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TNFRSF11BO00300 401 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 PDPK1O15530 556 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 EBLN1P0CF75 366 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ANXA8P13928 327 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 ABRQ12979 859 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 VEZF1Q14119 521 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TATDN3Q17R31 274 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MIXL1Q9H2W2 232 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 IMPAD1Q9NX62 359 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 TLR6Q9Y2C9 796 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 GPR182O15218 404 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 MC4RP32245 332 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 RHAGQ02094 409 aa21.1■□□□□ 0.97
CLDN5-201ENST00000403084 SMARCB1Q12824 385 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms