RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321027.7

GCFC2-201, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCFC2, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2-201ENST00000321027 A0A1W2PRB8 838 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PPP2R2BQ00005 443 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SCARB2Q14108 478 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 KCTD11Q693B1 232 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PXYLP1Q8TE99 480 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TFAP2CQ92754 450 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PEX13Q92968 403 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ARMC1Q9NVT9 282 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLC30A4O14863 429 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 LDB2O43679 373 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SYN1P17600 705 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PSMD8P48556 350 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 NXPE1Q8N323 547 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CADM2Q8N3J6 435 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SCAMP4Q969E2 229 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 BOCQ9BWV1 1114 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 OR2AG1Q9H205 316 aa14.94□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PENKP01210 267 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 IFNGP01579 166 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 NT5EP21589 574 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 IDSP22304 550 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 APLP1P51693 650 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RAB15P59190 212 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 HTRA3P83110 453 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 NFATC3Q12968 1075 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TUBA3CQ13748 450 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CARD16Q5EG05 197 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RPTNQ6XPR3 784 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 MEIOBQ8N635 442 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TMBIM6P55061 237 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RELTQ969Z4 430 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 FUNDC2Q9BWH2 189 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 OR51B5Q9H339 312 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 GABBR2O75899 941 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 NEK5Q6P3R8 708 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SIX5Q8N196 739 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 FRS2Q8WU20 508 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 FCGR1BQ92637 280 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 RHCGQ9UBD6 479 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 C2orf78A6NCI8 922 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 MCIDASD6RGH6 385 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 MNDAP41218 407 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PREPP48147 710 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ARF5P84085 180 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 Q6ZVL8 140 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SLC30A3Q99726 388 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 PHF11Q9UIL8 331 aa14.93□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 EVPLQ92817 2033 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 GMFGO60234 142 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 FGF4P08620 206 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 SEMA3AQ14563 771 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 C5orf22Q49AR2 442 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 USP43Q70EL4 1123 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 TDP1Q9NUW8 608 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 USP3Q9Y6I4 520 aa14.92□□□□□ -0.02
GCFC2-201ENST00000321027 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms