RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 MFSD9Q8NBP5 474 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 THAP11Q96EK4 314 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 MOCOSQ96EN8 888 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF285Q96NJ3 590 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 NDC1Q9BTX1 674 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 EFCAB11Q9BUY7 163 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ACTR8Q9H981 624 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 WDR70Q9NW82 654 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 RBBP7Q16576 425 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 HKDC1Q2TB90 917 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT6Q8NCL4 622 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 WDR34Q96EX3 536 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SARGQ9BW04 601 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 OR7A17O14581 309 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 P2RX6O15547 441 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 WFS1O76024 890 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SERPIND1P05546 499 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TSPAN8P19075 237 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CD22P20273 847 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SCTRP47872 440 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CCNG1P51959 295 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 LAPTM5Q13571 262 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PCLAFQ15004 111 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TBCCQ15814 346 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 UNC50Q53HI1 259 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 VN1R4Q7Z5H5 301 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ASPGQ86U10 573 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 C10orf107Q8IVU9 208 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SLC13A3Q8WWT9 602 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ARL8AQ96BM9 186 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 L3HYPDHQ96EM0 354 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 MACROD1Q9BQ69 325 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NLNQ9BYT8 704 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 OXSMQ9NWU1 459 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SRPK3Q9UPE1 567 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TXNDC9O14530 226 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SASH3O75995 380 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DLGAP3O95886 979 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 HBQ1P09105 142 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CASP2P42575 452 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CYP4F2P78329 520 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CLCQ05315 142 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL10Q6ZVT0 673 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CAMKVQ8NCB2 501 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TRPC4APQ8TEL6 797 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TLCD1Q96CP7 247 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CDK15Q96Q40 435 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SPRY4Q9C004 299 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 TXLNGQ9NUQ3 528 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NDOR1Q9UHB4 597 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ZFP69BQ9UJL9 534 aa21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 URB1O60287 2271 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 HYKKA2RU49 373 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 FITM1A5D6W6 292 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NDUFS4O43181 175 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CAPNS1P04632 268 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 SLC35G6P0C7Q6 338 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ATXN8OSP0DMR3 200 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 LIPCP11150 499 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ALAS2P22557 587 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 AHRP35869 848 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 ARSFP54793 590 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 NAGLUP54802 743 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PCDH1Q08174 1060 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 PRTGQ2VWP7 1150 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 FAM214AQ32MH5 1076 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP157Q5JU67 520 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 AGBL2Q5U5Z8 902 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 LIPMQ5VYY2 423 aa21.31■■□□□ 1
HOXD4-201ENST00000306324 LIPJQ5W064 366 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms