RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 OR8J2Q8NGG1 315 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TP53INP1Q96A56 240 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 BRCA2P51587 3418 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 H7C4K7 107 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 PRAMEF1O95521 474 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ADORA3P0DMS8 318 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ANXA8P13928 327 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC19A1P41440 591 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 C19orf48Q6RUI8 117 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC22A15Q8IZD6 547 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 MYOCQ99972 504 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CWH43Q9H720 699 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 C3orf14Q9HBI5 128 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 POFUT2Q9Y2G5 429 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CBX4O00257 560 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 GALTP07902 379 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 NFATC2Q13469 925 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 CARTPTQ16568 116 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF605Q86T29 641 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 UBQLNLQ8IYU4 475 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.08■■□□□ 1.13
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1B0GVM2 712 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD34BA5PLL1 514 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TLL1O43897 1013 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 VNN2O95498 520 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAPPC2P0DI81 140 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TRAPPC2BP0DI82 140 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TACR1P25103 407 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ACRV1P26436 265 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC15A1P46059 708 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 HTR3AP46098 478 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 OR2B6P58173 313 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGEF7Q14155 803 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 STARD3Q14849 445 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ARMCX4Q5H9R4 360 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR153Q6NV75 609 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 NDEL1Q9GZM8 345 aa22.08■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR39O43194 453 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SUV39H1O43463 412 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 UGT2B17O75795 530 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 AMD1P17707 334 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 EPORP19235 508 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 VEGFBP49765 207 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 KCNJ10P78508 379 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TWF1Q12792 350 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SMARCB1Q12824 385 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 HKDC1Q2TB90 917 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 STX19Q8N4C7 294 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 EID2BQ96D98 161 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SCLYQ96I15 445 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ASB8Q9H765 288 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 QPCTLQ9NXS2 382 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 MAPRE3Q9UPY8 281 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SCO2O43819 266 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SCN2BO60939 215 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GABRB1P18505 474 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GRK5P34947 590 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 RPS24P62847 133 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TEAD4Q15561 434 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 GPR33Q49SQ1 333 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 NOXRED1Q6NXP6 359 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM124AQ86V42 546 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC30A2Q9BRI3 323 aa22.06■■□□□ 1.12
ANKRD54-201ENST00000215941 TTPALQ9BTX7 342 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms