RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF878C9JN71 531 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FFAR3O14843 346 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 GPR42O15529 346 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TLE2Q04725 743 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 NTRK3Q16288 839 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF627Q7L945 461 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 PXKQ7Z7A4 578 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 OR10A6Q8NH74 314 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 OR2AG1Q9H205 316 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LDAHQ9H6V9 325 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 VWDEQ8N2E2 1590 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 F8VP50 259 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FBP2O00757 339 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 NPC1O15118 1278 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CPT2P23786 658 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 THBS2P35442 1172 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF84P51523 738 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SCGB2A2Q13296 93 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TPGS2Q68CL5 300 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FIBCD1Q8N539 461 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ACBD4Q8NC06 268 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LCN9Q8WX39 176 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ASB13Q8WXK3 278 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 EDEM1Q92611 657 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TTPALQ9BTX7 342 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TPK1Q9H3S4 243 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LRP5LA4QPB2 252 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RBBP9O75884 186 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CNTN5O94779 1100 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 AHSA1O95433 338 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CSF1P09603 554 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CHRNB2P17787 502 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TAS2R20P59543 309 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 BDH1Q02338 343 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ORC1Q13415 861 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ATG9BQ674R7 924 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM205Q6UW68 189 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 PIGZQ86VD9 579 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 BANPQ8N9N5 519 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 STON2Q8WXE9 905 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 MAL2Q969L2 176 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D17Q9HA65 648 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 PIP5K1BO14986 540 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 EPOP01588 193 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 GNSP15586 552 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 MAOAP21397 527 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CD79BP40259 229 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CDKN2CP42773 168 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RHDQ02161 417 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 DOK6Q6PKX4 331 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RELL1Q8IUW5 271 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SMPDL3AQ92484 453 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 P2RY11Q96G91 374 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ACBD6Q9BR61 282 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CEP41Q9BYV8 373 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CPVLQ9H3G5 476 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RLIMQ9NVW2 624 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 BTBD17A6NE02 478 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TBX1O43435 398 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 UGT1A9O60656 530 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TBL1XO60907 577 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 GLUD1P00367 558 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 UGT1A6P19224 532 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 UGT1A1P22309 533 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 UGT1A4P22310 534 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 LHCGRP22888 699 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CYP4F8P98187 520 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 PCDH1Q08174 1060 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CCNJQ5T5M9 372 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ADGRF1Q5T601 910 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 SSX6Q7RTT6 188 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 VSIG10LQ86VR7 867 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 OR9A4Q8NGU2 314 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 IL31RAQ8NI17 732 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 CMKLR1Q99788 373 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
SCN2A-209ENST00000636071 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms