RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	RNF139	Q8WU17	664 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TAF4B	Q92750	862 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TGM7	Q96PF1	710 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP45	Q9UL16	551 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ABCA1	O95477	2261 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RYR2	Q92736	4967 aa		4.68	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PCM1	Q15154	2024 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768		A6NNC1	897 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf96	A6NNT2	1141 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM10	O14672	748 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KLK8	O60259	260 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL41	O60662	606 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RASSF9	O75901	435 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	F10	P00742	488 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	HRG	P04196	525 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	EPHB2	P29323	1055 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	DNA2	P51530	1060 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	DLX5	P56178	289 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	FOXL2	P58012	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66	3e-6	■■■■□ 21.8
MLH1-223	ENST00000616768	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCNI	Q14094	377 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CHSY1	Q86X52	802 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ALG14	Q96F25	216 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PERP	Q96FX8	193 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	VPS28	Q9UK41	221 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PEX12	O00623	359 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SMPD2	O60906	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	KRT34	O76011	436 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CAPN1	P07384	714 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	PVR	P15151	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ABO	P16442	354 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SCP2	P22307	547 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	ACTR1B	P42025	376 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	SYK	P43405	635 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	GNPDA1	P46926	289 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CASP4	P49662	377 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	NR1H2	P55055	460 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MLH1-223	ENST00000616768	TBX4	P57082	545 aa		4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms