RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578501.5

CSNK1D-208, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-208	ENST00000578501	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	HNMT	P50135	292 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB43	Q86YS6	212 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PPM1N	Q8N819	430 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTER	Q96BW5	349 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	C10orf90	Q96M02	699 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SARG	Q9BW04	601 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.01	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RFPL1	O75677	317 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MED26	O95402	600 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	GUCA1C	O95843	209 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ANXA5	P08758	320 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PHB	P35232	272 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FOLR3	P41439	243 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RAB10	P61026	200 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ATP6V0D1	P61421	351 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM53B	Q14153	422 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MED25	Q71SY5	747 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	COX15	Q7KZN9	410 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CABS1	Q96KC9	395 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR4K3	Q96R72	315 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FMO2	Q99518	471 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGHE	P01854	428 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	UMOD	P07911	640 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCDC166	P0CW27	439 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CDH1	P12830	882 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CRABP2	P29373	138 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ECHS1	P30084	290 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	GRK3	P35626	688 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC26A3	P40879	764 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	OR1D4	P47884	311 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CCR8	P51685	355 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	RRAD	P55042	308 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGFBP7	Q16270	282 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NKG7	Q16617	165 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	NDUFA9	Q16795	377 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	HKDC1	Q2TB90	917 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	IFT81	Q8WYA0	676 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PYCR2	Q96C36	320 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CYTH2	Q99418	400 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	ING2	Q9H160	280 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TLK1	Q9UKI8	766 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		12.99	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	LRRK2	Q5S007	2527 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	COL12A1	Q99715	3063 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CEACAM4	O75871	244 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FAM155B	O75949	473 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	CD1D	P15813	335 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MMP11	P24347	488 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	OTX2	P32243	289 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	DSG2	Q14126	1118 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	SLC9A5	Q14940	896 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TGFBI	Q15582	683 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	PLD3	Q8IV08	490 aa		12.98	□□□□□ -0.33
CSNK1D-208	ENST00000578501	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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