RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572905.1

TOM1L1-215, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATP9A	O75110	1047 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	BAG3	O95817	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SP9	P0CG40	484 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	VCL	P18206	1134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	LHCGR	P22888	699 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ITGA3	P26006	1051 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SSTR1	P30872	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	STPG4	Q8N801	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905		R4GN57	208 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	P2RY10	O00398	339 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF197	O14709	1029 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PGRMC2	O15173	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC22A2	O15244	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CIDEA	O60543	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	GLRA3	O75311	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC22A3	O75751	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	MT-ND3	P03897	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	EDN1	P05305	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR3A1	P47881	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	NME5	P56597	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	MYL7	Q01449	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CETN1	Q12798	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	NPRL3	Q12980	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	LASP1	Q14847	261 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	XKR3	Q5GH77	459 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SNX21	Q969T3	373 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	NDN	Q99608	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905		A0A0G2JLW4	131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	EPHB6	O15197	1021 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SCO2	O43819	266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRT33A	O76009	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	OLFM2	O95897	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRSS1	P07477	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	F3	P13726	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	MT3	P25713	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SERPINB6	P35237	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR3A3	P47888	321 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDR2	Q01850	454 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	GCNT1	Q02742	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SQLE	Q14534	574 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-215	ENST00000572905	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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