RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NUDC	Q9Y266	331 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		2.67	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KANK1	Q14678	1352 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A096LPK6	155 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A0U1RQJ8	604 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FEZF1	A0PJY2	475 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM202	A6NGA9	273 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LGALS8	O00214	317 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD28	O15084	1053 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CTDSPL	O15194	276 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AP5Z1	O43299	807 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PPIP5K2	O43314	1243 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SSX4	O60224	188 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LDB3	O75112	727 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR6A2	O95222	327 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CH25H	O95992	272 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AGT	P01019	485 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPF	P07098	398 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CSN3	P07498	182 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	YES1	P07947	543 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	FGF4	P08620	206 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SBK2	P0C263	348 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	IQCF3	P0C7M6	154 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T7	P0C7T2	308 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EPCAM	P16422	314 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP11B2	P19099	503 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CD58	P19256	250 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PSMB4	P28070	264 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH4A1	P30038	563 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNA5	P30532	468 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CXCR3	P49682	368 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MTTP	P55157	894 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HAND2	P61296	217 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SORD	Q00796	357 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC34A1	Q06495	639 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PDK3	Q15120	406 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LCE3A	Q5TA76	89 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	BCORP1	Q8N888	145 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2T3	Q8NH03	318 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5C3B	Q969T7	300 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ESAM	Q96AP7	390 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SPDL1	Q96EA4	605 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	LINGO1	Q96FE5	620 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	AGAP3	Q96P47	875 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	RASL10B	Q96S79	203 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PCYT2	Q99447	389 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	OLFM1	Q99784	485 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EDEM2	Q9BV94	578 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	VCX2	Q9H322	139 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	EXO5	Q9H790	373 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
AKAP13-223	ENST00000560957	PALMD	Q9NP74	551 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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