RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MNDAP41218 407 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC11A1P49279 550 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBPJQ06330 500 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF844Q08AG5 666 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 BNIP3Q12983 259 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DNASE1L3Q13609 305 aa6.15□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 USP43Q70EL4 1123 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TAC4Q86UU9 113 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF596Q8TC21 504 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADAM33Q9BZ11 813 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 EDEM2Q9BV94 578 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RHBGQ9H310 441 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 H3BNH8 94 aa6.14□□□□□ -1.43
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PTPRB-210ENST00000551525 CYTIPO60759 359 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GLRA3O75311 464 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 APBB3O95704 486 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CSN2P05814 226 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 THRAP10827 490 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CMPK1P30085 196 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SPCS3P61009 180 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ORC1Q13415 861 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ELOCQ15369 112 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 VMACQ2NL98 169 aa6.14□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.14□□□□□ -1.43
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