RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ACP5	P13686	325 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KEL	P23276	732 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KDELR2	P33947	212 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	AVPR1B	P47901	424 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MVK	Q03426	396 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LCN8	Q6JVE9	175 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KDELC1	Q6UW63	502 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LCN9	Q8WX39	176 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MYRFL	Q96LU7	910 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BOC	Q9BWV1	1114 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ITPA	Q9BY32	194 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SP140L	Q9H930	580 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TAC3	Q9UHF0	121 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PCTP	Q9UKL6	214 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ING4	Q9UNL4	249 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		7.82	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	C2orf78	A6NCI8	922 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SCN2B	O60939	215 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PDYN	P01213	254 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BMP2	P12643	396 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CPOX	P36551	454 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	HLCS	P50747	726 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MYBPC3	Q14896	1274 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF404	Q494X3	552 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SPIN4	Q56A73	249 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TRIB2	Q92519	343 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	7.81	□□□□□ -1.16	2e-6	■■■□□ 16
NEK1-208	ENST00000512193	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TBX5	Q99593	518 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	KCNH6	Q9H252	994 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SRRD	Q9UH36	339 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ASB3	Q9Y575	518 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IRGM	A1A4Y4	181 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SOCS7	O14512	581 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CH25H	O95992	272 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	IFNG	P01579	166 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CBSL	P0DN79	551 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PSMA3	P25788	255 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ITPKB	P27987	946 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GABRB3	P28472	473 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CBS	P35520	551 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CLCNKA	P51800	687 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	RAB25	P57735	213 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	MYBPC1	Q00872	1141 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LGALS3BP	Q08380	585 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	GRIK2	Q13002	908 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TUBA3C	Q13748	450 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SPATS1	Q496A3	300 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC80	Q76M96	950 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OXR1	Q8N573	874 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	PIK3R3	Q92569	461 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	LMLN	Q96KR4	655 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		7.81	□□□□□ -1.16
NEK1-208	ENST00000512193	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		7.81	□□□□□ -1.16

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