RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 S100BP04271 92 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH1P12830 882 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 FBLP22087 321 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CRABP2P29373 138 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 AVPR1BP47901 424 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CSNK1G2P78368 415 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 HKDC1Q2TB90 917 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 PLD3Q8IV08 490 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 IFT20Q8IY31 132 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 TCAIMQ8N3R3 496 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 NACC2Q96BF6 587 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 DRC3Q9H069 523 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A1Q9H2B4 701 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNE2Q9Y6J6 123 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 NKG7Q16617 165 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 GPSM1Q86YR5 675 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 RELL1Q8IUW5 271 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC5A11Q8WWX8 675 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 MIEF2Q96C03 454 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC22A11Q9NSA0 550 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 KLHL41O60662 606 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP1A4Q13733 1029 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM53BQ14153 422 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ASPGQ86U10 573 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 ABHD11Q8NFV4 315 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC13A3Q8WWT9 602 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC22A14Q9Y267 594 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-210ENST00000505941 FEZF1A0PJY2 475 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 OR1F1O43749 312 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM155BO75949 473 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 C1QAP02745 245 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 CD1DP15813 335 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 CHAF1BQ13112 559 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 DSG2Q14126 1118 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 MRGPREQ86SM8 312 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 C10orf90Q96M02 699 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 AIF1LQ9BQI0 150 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 WWOXQ9NZC7 414 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 NINJ2Q9NZG7 142 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 CD274Q9NZQ7 290 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPC4Q9UBN4 977 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 RNF112Q9ULX5 631 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 ACOT9Q9Y305 439 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC28A2O43868 658 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAJB5O75953 348 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR47O94967 919 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 ACSL3O95573 720 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 GNAZP19086 355 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 MMP11P24347 488 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 CXCR2P25025 360 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC26A3P40879 764 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 PGDP52209 483 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 TGFBIQ15582 683 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 CDKL4Q5MAI5 379 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 MROH9Q5TGP6 573 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 COX15Q7KZN9 410 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 OR4K1Q8NGD4 311 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 STT3BQ8TCJ2 826 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 NEIL2Q969S2 332 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-210ENST00000505941 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms