RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 H3F3CQ6NXT2 135 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PACS1Q6VY07 963 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 LANCL3Q6ZV70 420 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A15Q8IZD6 547 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 AMER3Q8N944 861 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 OR2L3Q8NG85 312 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 HAUS1Q96CS2 278 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FOPNLQ96NB1 174 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP5.8□□□□□ -1.481e-14■■■■■ 57.9
CBX1-205ENST00000495350 CYTH2Q99418 400 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 LPAR4Q99677 370 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 TBL1YQ9BQ87 522 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 DPH7Q9BTV6 452 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MENTQ9BUN1 341 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MMP25Q9NPA2 562 aa5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 A0A087X0T9 212 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MACROD2A1Z1Q3 448 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 OR2A25A4D2G3 310 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SOWAHDA6NJG2 315 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 H7C0C1 242 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 H7C0S8 307 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SPOPO43791 374 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PDE9AO76083 593 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ATE1O95260 518 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 LY6G6DO95868 133 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FAM228BP0C875 321 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PRSS56P0CW18 603 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MSNP26038 577 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ACVR2AP27037 513 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PSMB4P28070 264 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 HOXC12P31275 282 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 UQCRC1P31930 480 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RFC3P40938 356 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ATP5OP48047 213 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 DCAF7P61962 342 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PTK6Q13882 451 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FAM53BQ14153 422 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 STX1AQ16623 288 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 HKDC1Q2TB90 917 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FLYWCH1Q4VC44 716 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SFT2D3Q587I9 215 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 LRRC38Q5VT99 294 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ZNF585AQ6P3V2 769 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RANBP10Q6VN20 620 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CHSY3Q70JA7 882 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ADCK2Q7Z695 626 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD37Q7Z713 158 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PIANPQ8IYJ0 282 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RPRMLQ8N4K4 120 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FAM222BQ8WU58 562 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 STYXQ8WUJ0 223 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SPATA13Q96N96 652 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CRIM1Q9NZV1 1036 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 B4GALT7Q9UBV7 327 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.481e-8■□□□□ 8.9
CBX1-205ENST00000495350 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.79□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 SYCE3A1L190 88 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 RNF212BA8MTL3 300 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 H0YIG0 161 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 BCKDKO14874 412 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 FOXS1O43638 330 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 PEX1O43933 1283 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 NRP2O60462 931 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 MAN1A2O60476 641 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CCNDBP1O95273 360 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 EZRP15311 586 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 CTNNA2P26232 953 aa5.78□□□□□ -1.48
CBX1-205ENST00000495350 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms