RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 ETV3P41162 512 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CASP9P55211 416 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 OR4D1Q15615 310 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 HACD2Q6Y1H2 254 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 LGI4Q8N135 537 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ABCA3Q99758 1704 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TFAP2AP05549 437 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 STT3AP46977 705 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NRIP1P48552 1158 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ALDH3A2P51648 485 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 BNIP3Q12983 259 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 XKR5Q6UX68 686 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 APCDD1Q8J025 514 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD49Q8WVL7 239 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ADAP2Q9NPF8 381 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SNX7Q9UNH6 387 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 A0A0J9YVX5 310 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 AURKAO14965 403 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 IL12AP29459 219 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TAS2R50P59544 299 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SH3BP2P78314 561 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MYBPC1Q00872 1141 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MYBPC3Q14896 1274 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF789Q5FWF6 425 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RAB7BQ96AH8 199 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SCRN2Q96FV2 425 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 KCNH6Q9H252 994 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 IL17CQ9P0M4 197 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 P2RX2Q9UBL9 471 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TSPAN6O43657 245 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RPL10P27635 214 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CDKL1Q00532 357 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF311Q5JNZ3 666 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 GPR150Q8NGU9 434 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF563Q8TA94 476 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 UBAP1Q9NZ09 502 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 AGRPO00253 132 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PGRMC2O15173 223 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MAGEB3O15480 346 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 OPN1SWP03999 348 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 C8BP07358 591 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ALOX5P09917 674 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 LINC01465Q8N7H1 131 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 COX18Q8N8Q8 333 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 OR5AK3PQ8NH89 298 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 GJD2Q9UKL4 321 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.58■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CTSAP10619 480 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 HTR1EP28566 365 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 COQ5Q5HYK3 327 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1W2PPW3 197 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 CLDN25C9JDP6 229 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLC30A4O14863 429 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 TFPTP0C1Z6 253 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 HSD3B1P14060 373 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 HSD3B2P26439 372 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 STAT5AP42229 794 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 NDUFAF6Q330K2 333 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 ATG9BQ674R7 924 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 C11orf88Q6PI97 169 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 SLC38A3Q99624 504 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 IGSF5Q9NSI5 407 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 BCKDHAP12694 445 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 BPIP17213 487 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 RYKP34925 604 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf172-201ENST00000436881 IL12RB1P42701 662 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms