RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 GGT2P36268 569 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KRT6CP48668 564 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 NELL1Q92832 810 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 Q96MT0 163 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 EPYCQ99645 322 aa14.47□□□□□ -0.09
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TOP3B-206ENST00000436282 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SNX6Q9UNH7 406 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa14.47□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 MFN2O95140 757 aa14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 KCNK5O95279 499 aa14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 ADORA3P0DMS8 318 aa14.46□□□□□ -0.09
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TOP3B-206ENST00000436282 PAF1Q8N7H5 531 aa14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 COL21A1Q96P44 957 aa14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 TTPALQ9BTX7 342 aa14.46□□□□□ -0.09
TOP3B-206ENST00000436282 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.46□□□□□ -0.09
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TOP3B-206ENST00000436282 DNTTP04053 509 aa14.46□□□□□ -0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 SELPP16109 830 aa14.46□□□□□ -0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 PIK3CBP42338 1070 aa14.46□□□□□ -0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 SLC11A2P49281 568 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 RGS6P49758 472 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ARMCX4Q5H9R4 360 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 LINGO4Q6UY18 593 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SPATA17Q96L03 361 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KCNC2Q96PR1 638 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.46□□□□□ -0.1
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TOP3B-206ENST00000436282 MARCH7Q9H992 704 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 AMBNQ9NP70 447 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.46□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KDELR3O43731 214 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CLDN9O95484 217 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PDYNP01213 254 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DGKAP23743 735 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TACR1P25103 407 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 OLR1P78380 273 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 BHMTQ93088 406 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 HHIPQ96QV1 700 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SRRDQ9UH36 339 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C1QCP02747 245 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 F11P03951 625 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 RHOCP08134 193 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ENGP17813 658 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 GPX2P18283 190 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 SDC1P18827 310 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP69Q49AA0 526 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 C5orf22Q49AR2 442 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PTOV1Q86YD1 416 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TET1Q8NFU7 2136 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa14.45□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 H7C4K7 107 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 PTHP01270 115 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 KLKB1P03952 638 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 STSP08842 583 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.44□□□□□ -0.15e-7■□□□□ 8.4
TOP3B-206ENST00000436282 MAPK1P28482 360 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ABRQ12979 859 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 STARD3Q14849 445 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 DUOXA1Q1HG43 343 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CPA6Q8N4T0 437 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TMCO6Q96DC7 493 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 IL17CQ9P0M4 197 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 CFL2Q9Y281 166 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 TRAPPC4Q9Y296 219 aa14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
TOP3B-206ENST00000436282 EPN2O95208 641 aa14.44□□□□□ -0.1
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