RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51B4Q9Y5P0 310 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 USH2AO75445 5202 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7EM74 188 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ABCD4O14678 606 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX28O15482 410 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRTM2O43300 516 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPP40O75818 363 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GLSO94925 669 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDRT1O95170 752 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCNT3O95395 438 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3-23P01764 117 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHG1P01857 330 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV4-34P06331 123 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 POU2F2P09086 479 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR2MP0CAP2 368 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKAR1AP10644 381 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 EDN2P20800 178 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZP3P21754 424 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH3P22223 829 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 GABRR1P24046 479 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 EDNRAP25101 427 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNFSF9P41273 254 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 LHX2P50458 406 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKAA2P54646 552 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBASH3AP57075 661 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP107P57740 925 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKAA1Q13131 559 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCL14Q16627 93 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 AP5B1Q2VPB7 878 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DEFB115Q30KQ5 88 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF528Q3MIS6 628 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCN1P1Q5VSP4 162 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 B3GNT9Q6UX72 402 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL20RBQ6UXL0 311 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF44Q7L0R7 432 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCGF5Q86SE9 256 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NME8Q8N427 588 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM99Q8N816 258 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAAF1Q8NEP3 725 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR13C3Q8NGS6 347 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHURC1Q8WUH1 139 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUFY2Q8WXA3 655 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NCSTNQ92542 709 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 HPS3Q969F9 1004 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX22Q96L94 193 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDOQ99489 341 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SORT1Q99523 831 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 COLEC11Q9BWP8 271 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 EHD1Q9H4M9 534 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 A4GALTQ9NPC4 353 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CHST12Q9NRB3 414 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP26Q9NRE1 261 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 P4HTMQ9NXG6 502 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IKZF2Q9UKS7 526 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 LZTS1Q9Y250 596 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CARD8Q9Y2G2 431 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SALL1Q9NSC2 1324 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 FER1L5A0AVI2 2057 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF320A2RRD8 509 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAP18O00422 153 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PES1O00541 588 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE8AO60658 829 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC24A1O60721 1099 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 KATNA1O75449 491 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 MPZL1O95297 269 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 ICAM1P05362 532 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 UQCRC2P22695 453 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSNK1DP48730 415 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 NT5C2P49902 561 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 BLKP51451 505 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCR6P51684 374 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 LBX1P52954 281 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMP2P54851 167 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNTN2Q02246 1040 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-172P-201ENST00000411000 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.4 ms