RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384561.1

RNU6-30P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 30, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-30P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-30P-201ENST00000384561 HOXA9P31269 272 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SLC4A3P48751 1232 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 GATMP50440 423 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DNA2P51530 1060 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 FUT6P51993 359 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SEC24CP53992 1094 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 CACNB3P54284 484 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 P2RX3P56373 397 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PPP2CBP62714 309 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PPP2CAP67775 309 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 CCNA1P78396 465 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RAE1P78406 368 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ARG2P78540 354 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SORDQ00796 357 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 AMPD2Q01433 879 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PAX5Q02548 391 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 MGAT5Q09328 741 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 KCNA1Q09470 495 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 LMOD3Q0VAK6 560 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 KLF10Q13118 480 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PLD1Q13393 1074 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RASGRF1Q13972 1273 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DLGAP5Q15398 846 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SEC23AQ15436 765 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TEAD2Q15562 447 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 CHI3L2Q15782 390 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 STXBP2Q15833 593 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DUOXA2Q1HG44 320 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PITRM1Q5JRX3 1037 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAM78AQ5JUQ0 283 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TIGD3Q6B0B8 471 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 APOOLQ6UXV4 268 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 UNC13DQ70J99 1090 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TTC6Q86TZ1 520 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 GTSCR1Q86UQ5 136 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PDSS2Q86YH6 399 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 GPIHBP1Q8IV16 184 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 EFCAB13Q8IY85 973 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 COLGALT2Q8IYK4 626 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 VPS52Q8N1B4 723 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TMEM256Q8N2U0 113 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 GPR137CQ8N3F9 429 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ALLCQ8N6M5 410 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 POU5F2Q8N7G0 328 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SPERTQ8NA61 448 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 IL17RDQ8NFM7 739 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 CCDC26Q8TAB7 109 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DTX3LQ8TDB6 740 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SCARB1Q8WTV0 552 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAM136AQ96C01 138 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 FAF2Q96CS3 445 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 CYFIP2Q96F07 1278 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 HES6Q96HZ4 224 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 C10orf90Q96M02 699 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 DUX3Q96PT4 197 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 FRG2BQ96QU4 278 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 CDADC1Q9BWV3 514 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 HDHD5Q9BXW7 423 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 C22orf23Q9BZE7 217 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 KLHL4Q9C0H6 718 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PPA2Q9H2U2 334 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 Q9H8V8 135 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 C17orf75Q9HAS0 396 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 LHX9Q9NQ69 397 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PLSCR3Q9NRY6 295 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RNF146Q9NTX7 359 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ACOXLQ9NUZ1 547 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 QPCTLQ9NXS2 382 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 GDE1Q9NZC3 331 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 MORF4L1Q9UBU8 362 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 B4GALT7Q9UBV7 327 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 MMP17Q9ULZ9 603 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 VWA7Q9Y334 891 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 STARD10Q9Y365 291 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 FBXO7Q9Y3I1 522 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 MMACHCQ9Y4U1 282 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-30P-201ENST00000384561 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms