RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354764.8

PGAP1-201, Transcript of post-GPI attachment to proteins 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGAP1, Length 11,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP1-201ENST00000354764 EXOC2Q96KP1 924 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 FNDC11Q9BVV2 318 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 RBPJLQ9UBG7 517 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 A0A1W2PRG6 482 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GSAPA4D1B5 854 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 LDB2O43679 373 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GSTM1P09488 218 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PKLRP30613 574 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 NUDT6P53370 316 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 SCARB2Q14108 478 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 E2F2Q14209 437 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CBLL1Q75N03 491 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KRT78Q8N1N4 520 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 NR4A3Q92570 626 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 HSPB11Q9Y547 144 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 HOXA2O43364 376 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 TSPAN3O60637 253 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 STSP08842 583 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 MS4A13Q5J8X5 152 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CCDC149Q6ZUS6 474 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 RFKQ969G6 155 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 AMBNQ9NP70 447 aa7.3□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PRSS23O95084 383 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GSTM3P21266 225 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KCNC4Q03721 635 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CHIT1Q13231 466 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KCNN2Q9H2S1 579 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CLMPQ9H6B4 373 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PROM1O43490 865 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 TLR5O60602 858 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 IRF1P10914 325 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CXCR2P25025 360 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 THPOP40225 353 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ADAM15Q13444 863 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CTF1Q16619 201 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PSKH2Q96QS6 385 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ARVCFO00192 962 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KDELR3O43731 214 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ALDH2P05091 517 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KCNC3Q14003 757 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 TIGARQ9NQ88 270 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 A0A1B0GVM2 712 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 HAS3O00219 553 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 NSG1P42857 185 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 OR7D4Q8NG98 312 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 DPAGT1Q9H3H5 408 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 SPON1Q9HCB6 807 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ABCA3Q99758 1704 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 MEIOCA2RUB1 952 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 IFNA16P05015 189 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PRR35P0CG20 571 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ARNTP27540 789 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 CRISP1P54107 249 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PTGR1Q14914 329 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 TRIB2Q92519 343 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 SSNA1O43805 119 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PRKYO43930 277 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 HLA-DPB1P04440 258 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PSKH1P11801 424 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 ACVR1Q04771 509 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 TAPT1Q6NXT6 567 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.29□□□□□ -1.24
PGAP1-201ENST00000354764 GPC2Q8N158 579 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms