RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSPNQ14714 243 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRMT9Q6P2P2 845 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTERQ96BW5 349 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 HAUS8Q9BT25 410 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 DERL2Q9GZP9 239 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF304Q9HCX3 659 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACSS2Q9NR19 701 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 OARD1Q9Y530 152 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 STATHP02808 62 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDGFAP04085 211 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 STMN1P16949 149 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ECHS1P30084 290 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKL1Q00532 357 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAB1Q13506 487 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRTP1Q5TC63 336 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF18AQ8NI77 898 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MVB12AQ96EY5 273 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM129AQ9BZQ8 928 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 FEZF1A0PJY2 475 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 VSTM2BA6NLU5 285 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC9O14530 226 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEACAM4O75871 244 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBLP22087 321 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPRP35270 261 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCL6P41182 706 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB10P61026 200 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 FRA10AC1Q70Z53 315 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED25Q71SY5 747 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL26A1Q96A83 441 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 THAP11Q96EK4 314 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 IP6K3Q96PC2 410 aa18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXS1O43638 330 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC28A2O43868 658 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA5P08758 320 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC166P0CW27 439 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD1DP15813 335 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMPRP36959 345 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL11P51671 97 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 DSG2Q14126 1118 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLMAPQ14BN4 828 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CMC1Q7Z7K0 106 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 RELL1Q8IUW5 271 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMER3Q8N944 861 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR4K1Q8NGD4 311 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC5A11Q8WWX8 675 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEIL2Q969S2 332 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 EGFL8Q99944 293 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRC3Q9H069 523 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 P4HTMQ9NXG6 502 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDC14AQ9UNH5 594 aa18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 I3L1I5 382 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SUV39H1O43463 412 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMP11P24347 488 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR8P51685 355 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRADP55042 308 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 CATSPEREQ5SY80 951 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASPGQ86U10 573 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFSD9Q8NBP5 474 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 STT3BQ8TCJ2 826 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM4SF19Q96DZ7 209 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 MACROD1Q9BQ69 325 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SARGQ9BW04 601 aa18.59■□□□□ 0.57
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPNS1Q9H2V7 528 aa18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms