RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ubap2Q91VX2 1132 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc22a7Q91WU2 540 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mat1aQ91X83 396 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ddx28Q9CWT6 540 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Olfr49Q9Z1V0 313 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Auts2A0A087WPF7 1261 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm3636E9Q5P1 227 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gp1baO35930 734 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cldn2O88552 230 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 St3gal5O88829 414 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zfp324Q78F42 583 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem98Q91X86 226 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 MlycdQ99J39 492 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Exosc1Q9DAA6 195 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cyp4v2Q9DBW0 525 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fbxl12Q9EPX5 326 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arl6O88848 186 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 JunbP09450 344 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Serpine1P22777 402 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 AdprhP54923 362 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eif2ak2Q03963 515 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Hexim2Q3TVI4 313 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nol9Q3TZX8 714 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Glb1l2Q3UPY5 636 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Syndig1lQ3USQ7 237 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arcn1Q5XJY5 511 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cdkn2cQ60772 168 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chst2Q80WV3 530 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cept1Q8BGS7 416 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4933430I17RikQ8BHW4 495 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gpr22Q8BZL4 432 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Klhl12Q8BZM0 568 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc3a1Q91WV7 685 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Snx4Q91YJ2 450 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dph2Q9CR25 489 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cops7aQ9CZ04 275 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Prkar1aQ9DBC7 381 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Osbpl3Q9DBS9 855 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 DstnQ9R0P5 165 aa13.47□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm43951A0A0N4SUT6 962 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ddi2A2ADY9 399 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm5407E9Q7Q1 248 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm4847G3X946 537 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 FkbplO35450 347 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Psma3O70435 255 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nfkbil1O88995 381 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 H2-Q7P14429 334 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 H2-Q9P14431 200 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Grik2P39087 908 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stt3aP46978 705 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 EpycP70186 322 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Neurog1P70660 244 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Brf2Q3UAW9 420 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Q6P2K3 674 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ckmt2Q6P8J7 419 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fastkd5Q7TMV3 762 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tmem202Q80W35 275 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ca12Q8CI85 354 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc5a11Q8K0E3 673 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 EedQ921E6 441 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tspan1Q99J59 240 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Creb3l1Q9Z125 519 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gpr137cE9Q343 423 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 OsmrO70458 971 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chrm1P12657 460 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Entpd1P55772 510 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Copz1P61924 177 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 PtnP63089 168 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Il18r1Q61098 537 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 BC061212Q6P8K3 481 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Znf513Q6PD29 541 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gpc2Q8BKV1 579 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Samd14Q8K070 417 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Vmn1r69Q8VIC1 319 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Atp5f1Q9CQQ7 256 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Spag4Q9JJF2 443 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Msgn1Q9JK54 188 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ltbp1Q8CG19 1712 aa13.46□□□□□ -0.25
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nkx1-1G3UXB3 402 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chst3O88199 472 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gstm1P10649 218 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CcnfP51944 777 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rps13P62301 151 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rps3P62908 243 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Bcl2a1bQ497M6 172 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rapgefl1Q68EF8 662 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Olfr384Q7TRX8 312 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc35e2Q8C811 405 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ankrd54Q91WK7 299 aa13.46□□□□□ -0.26
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Nphs2Q91X05 385 aa13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.6 ms