RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640184.1

CASP1-217, Transcript of caspase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP1, Length 327 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1-217ENST00000640184 CLDN9O95484 217 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 C1orf105O95561 183 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SEMA4FO95754 770 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SLC16A8O95907 504 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 IGLV1-40P01703 118 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 RPN2P04844 631 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 EBLN1P0CF75 366 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 THRAP10827 490 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CHRNB1P11230 501 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 IMPA1P29218 277 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 GGT5P36269 586 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TRIM23P36406 574 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 HALP42357 657 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 GNPDA1P46926 289 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 HTR6P50406 440 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 NUDT2P50583 147 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ATP4BP51164 291 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CLCNKAP51800 687 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 MNAT1P51948 309 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 DGKEP52429 567 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 NME5P56597 212 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CLDN2P57739 230 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 PFN3P60673 137 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TBPL1P62380 186 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 RPA4Q13156 261 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 NAE1Q13564 534 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 GRB7Q14451 532 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ABRAXAS2Q15018 415 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 HERC3Q15034 1050 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 RPS6KA2Q15349 733 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 MAPRE2Q15555 327 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 IMPG1Q17R60 797 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 MMEL1Q495T6 779 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 AGKQ53H12 422 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SGO1Q5FBB7 561 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 XKR7Q5GH72 579 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TTC23LQ6PF05 361 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 OGFOD3Q6PK18 319 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SYT13Q7L8C5 426 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TRIM69Q86WT6 500 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 RASGRP3Q8IV61 690 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ARHGAP24Q8N264 748 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 FNDC5Q8NAU1 212 aa4.55□□□□□ -1.68
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CASP1-217ENST00000640184 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 DENND6BQ8NEG7 585 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 OR2T11Q8NH01 316 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ASB12Q8WXK4 309 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SNX19Q92543 992 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 COX4I2Q96KJ9 171 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 PKP4Q99569 1192 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CCT7Q99832 543 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 C1orf50Q9BV19 199 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 NTMT1Q9BV86 223 aa4.55□□□□□ -1.68
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CASP1-217ENST00000640184 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 OR52A5Q9H2C5 316 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 RMI1Q9H9A7 625 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SGK2Q9HBY8 427 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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CASP1-217ENST00000640184 SLC23A2Q9UGH3 650 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 SUFUQ9UMX1 484 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 KCNK6Q9Y257 313 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 ASF1AQ9Y294 204 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 RNF11Q9Y3C5 154 aa4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CASP1-217ENST00000640184 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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