RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NXPE1Q8N323 547 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 HEXDCQ8WVB3 486 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CD180Q99467 661 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 IGSF5Q9NSI5 407 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MED16Q9Y2X0 877 aa23.26■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SEC16AO15027 2179 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS56P0CW18 603 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 VCLP18206 1134 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A6P19224 532 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A1P22309 533 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 UGT1A4P22310 534 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FMO4P31512 558 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 RPS15P62841 145 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD11B2P80365 405 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 KCTD4Q8WVF5 259 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NXNL1Q96CM4 212 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 LRFN5Q96NI6 719 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NUDT9Q9BW91 350 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSS2Q9NR19 701 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 LATS2Q9NRM7 1088 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 LUZP4Q9P127 313 aa23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CSMD1Q96PZ7 3565 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 A1L4Q6 167 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 G3V2L1 256 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS26AO75436 327 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SCRG1O75711 98 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NEFHP12036 1026 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH3A1P30838 453 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ITGA1P56199 1179 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZYG11AQ6WRX3 759 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MICALCLQ6ZW33 695 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC63Q8NA47 563 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DDHD1Q8NEL9 900 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 MR1Q95460 341 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 C7orf26Q96N11 449 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM96AQ9H5X1 160 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF358Q9NW07 568 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CRLS1Q9UJA2 301 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 BTRCQ9Y297 605 aa23.24■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR91A4D1P6 747 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 WIPF3A6NGB9 483 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX3O60493 162 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINE1P05121 402 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC166P0CW27 439 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 RORAP35398 523 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NSG1P42857 185 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V0D1P61421 351 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ASPHQ12797 758 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DLG1Q12959 904 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ABRQ12979 859 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PCLAFQ15004 111 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 METRNLQ641Q3 311 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL35Q6PF15 583 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 RHEBL1Q8TAI7 183 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC126Q96EE4 140 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCD4Q9BRC7 762 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP1Q9NVV9 213 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 HRASLS2Q9NWW9 162 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GNPTGQ9UJJ9 305 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa23.23■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa23.23■■□□□ 1.31
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 BGNP21810 368 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2H3Q13889 308 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSL3PQ5NE16 218 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC6A19Q695T7 634 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM220Q6QAJ8 160 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM198BQ6UWH4 519 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM207Q6UWW9 146 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DSELQ8IZU8 1212 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TCTN2Q96GX1 697 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 COPS8Q99627 209 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DERL2Q9GZP9 239 aa23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CAPNS1-216ENST00000628306 OXSMQ9NWU1 459 aa23.22■■□□□ 1.31
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