RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 HALP42357 657 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 HNMTP50135 292 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 IFITM3Q01628 133 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 GAB1Q13480 694 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RFX4Q33E94 735 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MPPE1Q53F39 396 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TCAIMQ8N3R3 496 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CPA6Q8N4T0 437 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 OR4K3Q96R72 315 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SIGLEC11Q96RL6 698 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ARMC7Q9H6L4 198 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 COQ6Q9Y2Z9 468 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PQ67 120 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MYO1GB0I1T2 1018 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MT-ND2P03891 347 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 KDELR2P33947 212 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SLC7A9P82251 487 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CBLL1Q75N03 491 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SYNPOQ8N3V7 929 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SAMD11Q96NU1 681 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SNX5Q9Y5X3 404 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf226A1L170 272 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP99D6REC4 459 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CBFA2T3O75081 653 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 JRKO75564 520 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FABP3P05413 133 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 OCM2P0CE71 109 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TRPC1P48995 793 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SP140Q13342 867 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 NPTX1Q15818 432 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZVU0 165 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SYT12Q8IV01 421 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZFP90Q8TF47 636 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SH3KBP1Q96B97 665 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 C7orf34Q96L11 122 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM184CQ9NVA4 438 aa12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FADS2P1A8MWK0 482 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEB17A8MXT2 336 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 LEFTY2O00292 366 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PRPS1L1P21108 318 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FPR1P21462 350 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MAPK1P28482 360 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CD97P48960 835 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PHEXP78562 749 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 IL1RL1Q01638 556 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ACOX1Q15067 660 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CYP2A13Q16696 494 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FAHD1Q6P587 224 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 OR8J2Q8NGG1 315 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MAL2Q969L2 176 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FAM8A1Q9UBU6 413 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ALPK3Q96L96 1907 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 SH3BGRLO75368 114 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PARNO95453 639 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 TGFBR2P37173 567 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ITGA1P56199 1179 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 VBP1P61758 197 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 KCNJ10P78508 379 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ITGADQ13349 1161 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FAM124AQ86V42 546 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 MFSD4AQ8N468 514 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PCDH12Q9NPG4 1184 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 ERVW-1Q9UQF0 538 aa12.91□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PRU2 124 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHGA12O60330 932 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJB5O75953 348 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 FADS2O95864 444 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 COX7A2P14406 83 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 HIST1H2ADP20671 130 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 C21orf58P58505 322 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 LSM3P62310 102 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 CREMQ03060 361 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 PTPRSQ13332 1948 aa12.9□□□□□ -0.34
C9orf170-201ENST00000623052 DOC2AQ14183 400 aa12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms