RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 PAFAH2Q99487 392 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC25A23Q9BV35 468 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GPR87Q9BY21 358 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FAM129AQ9BZQ8 928 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RHOJQ9H4E5 214 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 NPHS2Q9NP85 383 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TLK1Q9UKI8 766 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SNX7Q9UNH6 387 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM33Q9UPN9 1127 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ICKQ9UPZ9 632 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DHRS7Q9Y394 339 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ASB1Q9Y576 335 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.66□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 A0A1W2PPV9 198 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ARGFXA6NJG6 315 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MATN2O00339 956 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 BTN3A3O00478 584 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 HCRTR1O43613 425 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 VPS4BO75351 444 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJB5O75953 348 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MATN4O95460 622 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CTSBP07858 339 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GSTA2P09210 222 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SBK3P0C264 359 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 OR56A5P0C7T3 313 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC35E2BP0CK96 405 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ACPPP15309 386 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PAMP19021 973 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GP5P40197 560 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PGDP52209 483 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MLLT10P55197 1068 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TUBB4BP68371 445 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 HSPA14Q0VDF9 509 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ABRQ12979 859 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CHAF1BQ13112 559 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PRKG2Q13237 762 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KLHL38Q2WGJ6 581 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SYTL3Q4VX76 610 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SBSNQ6UWP8 590 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SYVN1Q86TM6 617 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SLC26A11Q86WA9 606 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC6Q86X45 466 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 FAM20CQ8IXL6 584 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PALM2Q8IXS6 379 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LMNTD2Q8IXW0 634 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GPR135Q8IZ08 494 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 D2HGDHQ8N465 521 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ZBTB2Q8N680 514 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GPATCH11Q8N954 259 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 OR8K5Q8NH50 307 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 THAP4Q8WY91 577 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KCNJ9Q92806 393 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ISL2Q96A47 359 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PTERQ96BW5 349 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 GPR78Q96P69 363 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 RUFY1Q96T51 708 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TTC1Q99614 292 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 HGH1Q9BTY7 390 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 KLHL25Q9H0H3 589 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 CHST8Q9H2A9 424 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 XKR8Q9H6D3 395 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 C1GALT1Q9NS00 363 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 VPS4AQ9UN37 437 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PLAAQ9Y263 795 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.65□□□□□ -1.5
LINC00963-215ENST00000622972 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.64□□□□□ -1.51
LINC00963-215ENST00000622972 SCN2AQ99250 2005 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms