RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ESX1Q8N693 406 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 EXD3Q8N9H8 876 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 OR8K5Q8NH50 307 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 MED8Q96G25 268 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 FAM107BQ9H098 131 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ALG9Q9H6U8 611 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PDE7BQ9NP56 450 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 MKS1Q9NXB0 559 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SENP1Q9P0U3 644 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TBK1Q9UHD2 729 aa9.5□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.5□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ATP8B1O43520 1251 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GLRA3O75311 464 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GUCA1CO95843 209 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FGF5P12034 268 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 FOLR1P15328 257 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ST6GAL1P15907 406 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 ZNF844Q08AG5 666 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 ATG10Q9H0Y0 220 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 CXorf56Q9H5V9 222 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 PCMTD2Q9NV79 361 aa9.49□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 TAC3Q9UHF0 121 aa9.49□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 SEC16AO15027 2179 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 FER1L5A0AVI2 2057 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 A0A1W2PPM1 405 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TLDC2A0PJX2 215 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 OR2A25A4D2G3 310 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 STX16O14662 325 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 MAP2K7O14733 419 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 NKX2-8O15522 239 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KALRNO60229 2985 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KIAA0754O94854 1291 aa9.48□□□□□ -0.89
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GGA3-209ENST00000580646 NPPBP16860 134 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 MAGP20916 626 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PSMB5P28074 263 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CRHR1P34998 444 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GMPRP36959 345 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 STAT5AP42229 794 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GRIA3P42263 894 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 GABRA4P48169 554 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 KCNC1P48547 511 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 CCT5P48643 541 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 NFKB2Q00653 900 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 PCDH1Q08174 1060 aa9.48□□□□□ -0.89
GGA3-209ENST00000580646 TUBB3Q13509 450 aa9.48□□□□□ -0.89
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