RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556718.1

PRPF39-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF39, Length 499 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-210ENST00000556718 SDCBP2Q9H190 292 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 ABCG8Q9H221 673 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 ACTL8Q9H568 366 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 Q9H8V8 135 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 EBF2Q9HAK2 575 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 CHST11Q9NPF2 352 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 IL19Q9UHD0 177 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 GPR132Q9UNW8 380 aa4□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 A0A1W2PN81 502 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 A0A1W2PS18 150 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 F8VVB4 439 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 F8VWA3 439 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 SBK2P0C263 348 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 ANKRD34CP0C6C1 535 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 SERPINB6P35237 376 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 ARHGAP1Q07960 439 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 CTR9Q6PD62 1173 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 ZNF619Q8N2I2 560 aa3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 FAM20AQ96MK3 541 aa3.99□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 IGHV4-39P01824 125 aa3.98□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 CDH3P22223 829 aa3.98□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 CETN1Q12798 172 aa3.98□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 OR2T12Q8NG77 320 aa3.98□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 IGSF21Q96ID5 467 aa3.98□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa3.98□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 RUNDC3BQ96NL0 473 aa3.98□□□□□ -1.77
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PRPF39-210ENST00000556718 TMEM237Q96Q45 408 aa3.98□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 PRAM1Q96QH2 718 aa3.98□□□□□ -1.77
PRPF39-210ENST00000556718 PANX3Q96QZ0 392 aa3.98□□□□□ -1.77
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